Detailed information of deep learning profile BP001081.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for E2F1 in MCF-7 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: E2F1
Model ID: BP001081.1
Cell line/tissue: MCF-7
Class: Fork head/winged helix factors
Family: E2F
JASPAR ID: UN0490.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q01094  
Source: ENCSR000EWX
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.03 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.06 0.00 0.04 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.01 0.00 0.02 0.00 0.03 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.04 0.00 0.06 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 215 231 174 216 200 201 190 212 209 180 217 206 228 188 229 212 144 34 32 31 51 82 251 253 246 223 285 206 140 13 14 12 7 15 243 267 238 225 178 187 233 178 175 201 187 159 178 216 178 172 ]
C [ 443 410 481 437 430 451 451 428 459 405 441 443 422 418 477 343 582 365 1118 71 846 434 416 408 398 424 338 298 544 173 1206 34 1052 520 536 309 412 379 484 416 445 426 489 416 456 493 445 411 455 430 ]
G [ 404 473 434 433 448 426 464 438 418 479 412 424 434 503 375 508 481 832 93 1128 330 585 408 404 394 414 367 534 562 1073 35 1212 192 612 283 379 390 430 394 435 368 476 419 431 424 440 435 469 446 451 ]
T [ 206 154 179 182 190 190 163 190 182 204 198 195 184 159 187 205 61 37 25 38 41 167 193 203 230 207 278 230 22 9 13 10 17 121 206 313 228 234 212 230 222 188 185 220 201 176 210 172 189 215 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.03 -0.03 -0.03 -0.03 -0.02 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.05 -0.04 -0.05 -0.05 -0.04 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.00 0.01 0.00 0.02 0.00 0.03 -0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.02 0.01 0.06 -0.02 0.04 0.01 0.01 0.00 0.01 0.00 ]
G [ 0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.03 -0.01 0.03 0.01 0.02 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.01 0.04 -0.02 0.06 0.01 0.03 0.00 0.01 0.01 0.01 ]
T [ -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.03 -0.03 -0.03 -0.03 -0.03 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.03 -0.05 -0.05 -0.04 -0.05 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_11

Num. of seqlets: 131

6 profiles found for the same TF (E2F1) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001079.1 E2F1 ENCSR000EVJ HeLa-S3 Homo sapiens UN0490.2
BP001080.1 E2F1 ENCSR000EVM HeLa-S3 Homo sapiens UN0490.2
BP001082.1 E2F1 ENCSR153DWR K562 Homo sapiens MA0024.3
BP001083.1 E2F1 ENCSR563LLO K562 Homo sapiens MA0024.3
BP001084.1 E2F1 ENCSR717ZZW HepG2 Homo sapiens MA0024.3
BP001085.1 E2F1 ENCSR836SPL WTC11 Homo sapiens UN0490.2
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