Detailed information of deep learning profile BP001081.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for E2F1 in MCF-7 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: E2F1
Model ID: BP001081.1
Cell line/tissue: MCF-7
Class: Fork head/winged helix factors
Family: E2F
JASPAR ID: UN0490.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q01094  
Source: ENCSR000EWX
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.06 0.00 0.04 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.03 0.00 0.02 0.00 0.01 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.04 0.00 0.06 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.03 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 215 189 172 210 176 201 220 185 188 222 230 212 234 228 313 206 121 17 10 13 9 22 230 278 207 230 203 193 167 41 38 25 37 61 205 187 159 184 195 198 204 182 190 163 190 190 182 179 154 206 ]
C [ 451 446 469 435 440 424 431 419 476 368 435 394 430 390 379 283 612 192 1212 35 1073 562 534 367 414 394 404 408 585 330 1128 93 832 481 508 375 503 434 424 412 479 418 438 464 426 448 433 434 473 404 ]
G [ 430 455 411 445 493 456 416 489 426 445 416 484 379 412 309 536 520 1052 34 1206 173 544 298 338 424 398 408 416 434 846 71 1118 365 582 343 477 418 422 443 441 405 459 428 451 451 430 437 481 410 443 ]
T [ 172 178 216 178 159 187 201 175 178 233 187 178 225 238 267 243 15 7 12 14 13 140 206 285 223 246 253 251 82 51 31 32 34 144 212 229 188 228 206 217 180 209 212 190 201 200 216 174 231 215 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.05 -0.04 -0.05 -0.05 -0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.03 -0.03 -0.03 -0.03 -0.03 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 ]
C [ 0.01 0.01 0.01 0.00 0.03 0.01 0.06 -0.02 0.04 0.01 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.02 0.01 0.03 -0.01 0.03 0.01 0.01 0.00 0.01 0.00 ]
G [ 0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.04 -0.02 0.06 0.01 0.02 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 -0.01 0.03 0.00 0.02 0.00 0.01 0.00 0.01 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.04 -0.05 -0.05 -0.04 -0.05 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.02 -0.03 -0.03 -0.03 -0.03 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_11

Num. of seqlets: 131

6 profiles found for the same TF (E2F1) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001079.1 E2F1 ENCSR000EVJ HeLa-S3 Homo sapiens UN0490.2
BP001080.1 E2F1 ENCSR000EVM HeLa-S3 Homo sapiens UN0490.2
BP001082.1 E2F1 ENCSR153DWR K562 Homo sapiens MA0024.3
BP001083.1 E2F1 ENCSR563LLO K562 Homo sapiens MA0024.3
BP001084.1 E2F1 ENCSR717ZZW HepG2 Homo sapiens MA0024.3
BP001085.1 E2F1 ENCSR836SPL WTC11 Homo sapiens UN0490.2
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