Detailed information of deep learning profile BP001112.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for SP1 in MCF-7 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: SP1
Model ID: BP001112.1
Cell line/tissue: MCF-7
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Three-zinc finger Kruppel-related
JASPAR ID: MA0079.5
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P08047  
Source: ENCSR729LGA
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

A [ 106 113 97 95 92 93 103 79 104 83 78 88 97 93 79 79 80 139 131 61 22 17 50 3 5 8 4 35 112 74 92 91 89 89 73 88 87 100 72 97 80 102 94 105 97 93 97 119 106 112 ]
C [ 321 291 314 287 313 307 313 315 284 324 352 362 321 299 338 364 373 277 197 86 536 538 557 678 13 658 649 594 493 253 242 336 366 411 322 225 320 329 351 350 280 308 300 308 298 302 290 298 309 283 ]
G [ 166 157 177 178 157 167 154 191 173 139 114 99 161 183 137 117 113 63 270 463 52 39 42 8 653 14 35 33 19 164 99 131 133 95 187 250 173 166 140 140 217 154 177 151 180 173 177 153 170 174 ]
T [ 99 131 104 132 130 125 122 107 131 146 148 143 113 117 138 132 126 213 94 82 82 98 43 3 21 12 4 30 68 201 259 134 104 97 110 129 112 97 129 105 115 128 121 128 117 124 128 122 107 123 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 521

7 profiles found for the same TF (SP1) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001106.1 SP1 ENCSR000BHK GM12878 Homo sapiens MA0079.5
BP001107.1 SP1 ENCSR000BIR H1 Homo sapiens MA0079.5
BP001108.1 SP1 ENCSR000BKO K562 Homo sapiens MA0079.5
BP001109.1 SP1 ENCSR372IML K562 Homo sapiens MA0079.5
BP001110.1 SP1 ENCSR460YAM HepG2 Homo sapiens MA0079.5
BP001111.1 SP1 ENCSR583CGO WTC11 Homo sapiens MA0079.5
BP001113.1 SP1 ENCSR991ELG K562 Homo sapiens MA0079.5
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