Detailed information of deep learning profile BP001112.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for SP1 in MCF-7 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: SP1
Model ID: BP001112.1
Cell line/tissue: MCF-7
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Three-zinc finger Kruppel-related
JASPAR ID: MA0079.5
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P08047  
Source: ENCSR729LGA
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 123 107 122 128 124 117 128 121 128 115 105 129 97 112 129 110 97 104 134 259 201 68 30 4 12 21 3 43 98 82 82 94 213 126 132 138 117 113 143 148 146 131 107 122 125 130 132 104 131 99 ]
C [ 174 170 153 177 173 180 151 177 154 217 140 140 166 173 250 187 95 133 131 99 164 19 33 35 14 653 8 42 39 52 463 270 63 113 117 137 183 161 99 114 139 173 191 154 167 157 178 177 157 166 ]
G [ 283 309 298 290 302 298 308 300 308 280 350 351 329 320 225 322 411 366 336 242 253 493 594 649 658 13 678 557 538 536 86 197 277 373 364 338 299 321 362 352 324 284 315 313 307 313 287 314 291 321 ]
T [ 112 106 119 97 93 97 105 94 102 80 97 72 100 87 88 73 89 89 91 92 74 112 35 4 8 5 3 50 17 22 61 131 139 80 79 79 93 97 88 78 83 104 79 103 93 92 95 97 113 106 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 521

7 profiles found for the same TF (SP1) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001106.1 SP1 ENCSR000BHK GM12878 Homo sapiens MA0079.5
BP001107.1 SP1 ENCSR000BIR H1 Homo sapiens MA0079.5
BP001108.1 SP1 ENCSR000BKO K562 Homo sapiens MA0079.5
BP001109.1 SP1 ENCSR372IML K562 Homo sapiens MA0079.5
BP001110.1 SP1 ENCSR460YAM HepG2 Homo sapiens MA0079.5
BP001111.1 SP1 ENCSR583CGO WTC11 Homo sapiens MA0079.5
BP001113.1 SP1 ENCSR991ELG K562 Homo sapiens MA0079.5
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