Detailed information of deep learning profile BP001065.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for STAT1 in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: STAT1
Model ID: BP001065.1
Cell line/tissue: K562
Class: STAT domain factors
Family: STAT factors
JASPAR ID: MA0517.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q53XW4  
Source: ENCSR000FAU
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.08 0.06 0.01 -0.00 -0.00 0.06 0.07 0.06 0.00 -0.00 0.00 0.02 0.01 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ -0.00 0.00 0.01 0.02 0.04 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.06 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 222 226 200 223 201 219 204 209 192 186 190 209 212 205 242 244 201 262 256 147 519 771 743 289 102 54 717 748 737 43 61 192 470 354 284 189 182 209 223 202 223 229 209 238 192 219 249 214 204 200 ]
C [ 172 170 185 169 194 194 167 203 172 189 202 200 171 139 136 197 191 129 71 14 6 1 17 231 262 11 19 16 15 548 199 128 102 125 147 226 192 177 161 160 189 191 184 153 177 173 166 219 181 194 ]
G [ 206 186 226 193 201 180 208 179 222 217 234 215 215 190 216 143 185 308 422 597 254 5 17 140 126 709 43 14 29 174 46 275 122 192 205 191 208 221 226 233 191 206 227 222 225 228 216 212 190 197 ]
T [ 190 208 179 205 194 197 211 199 204 198 164 166 192 256 196 206 213 91 41 32 11 13 13 130 300 16 11 12 9 25 484 195 96 119 154 184 208 183 180 195 187 164 170 177 196 170 159 145 215 199 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.01 0.00 0.04 0.08 0.06 0.01 -0.03 -0.01 0.06 0.07 0.06 -0.02 -0.03 -0.00 0.02 0.01 0.01 ]
C [ -0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 -0.02 -0.05 -0.05 -0.02 0.01 0.04 -0.03 -0.03 -0.02 -0.01 0.04 0.02 -0.01 -0.01 -0.00 0.01 ]
G [ 0.01 -0.00 0.01 0.02 0.03 0.04 0.02 -0.04 -0.02 -0.01 -0.00 0.06 -0.02 -0.04 -0.03 0.01 0.00 0.01 -0.01 -0.01 -0.00 ]
T [ 0.01 -0.01 -0.00 -0.02 -0.04 -0.02 -0.02 -0.02 -0.03 -0.01 0.00 -0.02 -0.02 -0.02 -0.04 -0.03 0.02 0.01 -0.01 -0.01 -0.01 ]

4 profiles found for the same TF (STAT1) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001062.1 STAT1 ENCSR000EHJ K562 Homo sapiens MA0137.4
BP001063.1 STAT1 ENCSR000EHK K562 Homo sapiens MA0137.4
BP001064.1 STAT1 ENCSR000EZK HeLa-S3 Homo sapiens MA0137.4
BP001066.1 STAT1 ENCSR000FAV K562 Homo sapiens MA0137.4
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