Detailed information of deep learning profile BP001063.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for STAT1 in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: STAT1
Model ID: BP001063.1
Cell line/tissue: K562
Class: STAT domain factors
Family: STAT factors
JASPAR ID: MA0137.4
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q53XW4  
Source: ENCSR000EHK
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.01 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.13 0.14 0.02 -0.00 -0.00 0.01 ]
C [ 0.01 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.08 0.05 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 ]
G [ 0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.07 0.06 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.01 0.01 ]
T [ 0.01 -0.00 -0.01 0.03 0.14 0.11 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.01 -0.00 -0.01 ]

Frequency matrix

A [ 343 379 358 380 376 271 284 482 396 524 463 310 335 398 424 261 237 285 189 596 87 13 48 76 79 466 143 98 1334 1348 532 186 220 409 238 282 349 248 284 247 388 330 234 233 269 268 314 407 337 559 ]
C [ 248 260 348 322 264 275 259 264 239 234 215 273 303 455 404 380 390 322 475 181 320 5 40 1263 781 181 35 30 32 12 261 290 367 370 481 394 240 362 368 544 385 251 336 338 585 566 447 273 245 283 ]
G [ 350 372 363 362 325 558 579 391 378 253 418 444 324 285 263 330 481 296 528 296 214 15 51 19 46 485 1159 1023 5 13 340 253 668 405 417 347 413 473 422 286 252 259 245 253 252 257 233 387 504 244 ]
T [ 443 373 315 320 419 280 262 247 371 373 288 357 422 246 293 413 276 481 192 311 763 1351 1245 26 478 252 47 233 13 11 251 655 129 200 248 361 382 301 310 307 359 544 569 560 278 293 390 317 298 298 ]

Hypothetical CWM

A [ 0.01 -0.02 -0.01 -0.05 -0.03 0.02 -0.06 -0.09 -0.05 0.02 -0.06 -0.03 -0.00 -0.04 0.13 0.14 0.04 -0.03 -0.01 0.01 -0.01 -0.00 -0.02 ]
C [ 0.01 0.02 0.01 0.03 0.03 -0.02 0.02 -0.08 -0.07 0.08 0.08 0.04 -0.04 -0.08 -0.04 -0.05 -0.02 0.03 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.02 0.03 0.01 0.03 0.02 -0.03 -0.05 -0.05 -0.08 -0.03 0.04 0.08 0.07 -0.09 -0.06 0.02 -0.02 0.03 0.03 0.00 0.01 0.01 ]
T [ -0.02 -0.01 -0.01 0.02 -0.02 -0.02 0.05 0.14 0.11 -0.05 0.00 -0.04 -0.06 0.02 -0.06 -0.09 -0.05 0.02 -0.04 -0.04 -0.01 -0.02 0.01 ]

4 profiles found for the same TF (STAT1) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001062.1 STAT1 ENCSR000EHJ K562 Homo sapiens MA0137.4
BP001064.1 STAT1 ENCSR000EZK HeLa-S3 Homo sapiens MA0137.4
BP001065.1 STAT1 ENCSR000FAU K562 Homo sapiens MA0517.2
BP001066.1 STAT1 ENCSR000FAV K562 Homo sapiens MA0137.4
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