Detailed information of deep learning profile BP001065.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for STAT1 in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: STAT1
Model ID: BP001065.1
Cell line/tissue: K562
Class: STAT domain factors
Family: STAT factors
JASPAR ID: MA0517.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q53XW4  
Source: ENCSR000FAU
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.06 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.04 0.02 0.01 0.00 -0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.01 0.02 0.00 -0.00 0.00 0.06 0.07 0.06 -0.00 -0.00 0.01 0.06 0.08 0.03 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 199 215 145 159 170 196 177 170 164 187 195 180 183 208 184 154 119 96 195 484 25 9 12 11 16 300 130 13 13 11 32 41 91 213 206 196 256 192 166 164 198 204 199 211 197 194 205 179 208 190 ]
C [ 197 190 212 216 228 225 222 227 206 191 233 226 221 208 191 205 192 122 275 46 174 29 14 43 709 126 140 17 5 254 597 422 308 185 143 216 190 215 215 234 217 222 179 208 180 201 193 226 186 206 ]
G [ 194 181 219 166 173 177 153 184 191 189 160 161 177 192 226 147 125 102 128 199 548 15 16 19 11 262 231 17 1 6 14 71 129 191 197 136 139 171 200 202 189 172 203 167 194 194 169 185 170 172 ]
T [ 200 204 214 249 219 192 238 209 229 223 202 223 209 182 189 284 354 470 192 61 43 737 748 717 54 102 289 743 771 519 147 256 262 201 244 242 205 212 209 190 186 192 209 204 219 201 223 200 226 222 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.02 -0.03 -0.04 -0.02 -0.02 -0.02 0.00 -0.01 -0.03 -0.02 -0.02 -0.02 -0.04 -0.02 -0.00 -0.01 0.01 ]
C [ -0.00 -0.01 -0.01 0.01 0.00 0.01 -0.03 -0.04 -0.02 0.06 -0.00 -0.01 -0.02 -0.04 0.02 0.04 0.03 0.02 0.01 -0.00 0.01 ]
G [ 0.01 -0.00 -0.01 -0.01 0.02 0.04 -0.01 -0.02 -0.03 -0.03 0.04 0.01 -0.02 -0.05 -0.05 -0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 -0.01 ]
T [ 0.01 0.01 0.02 -0.00 -0.03 -0.02 0.06 0.07 0.06 -0.01 -0.03 0.01 0.06 0.08 0.04 0.00 0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 ]

4 profiles found for the same TF (STAT1) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001062.1 STAT1 ENCSR000EHJ K562 Homo sapiens MA0137.4
BP001063.1 STAT1 ENCSR000EHK K562 Homo sapiens MA0137.4
BP001064.1 STAT1 ENCSR000EZK HeLa-S3 Homo sapiens MA0137.4
BP001066.1 STAT1 ENCSR000FAV K562 Homo sapiens MA0137.4
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