Detailed information of deep learning profile BP001063.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for STAT1 in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: STAT1
Model ID: BP001063.1
Cell line/tissue: K562
Class: STAT domain factors
Family: STAT factors
JASPAR ID: MA0137.4
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q53XW4  
Source: ENCSR000EHK
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.01 -0.00 0.01 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.11 0.14 0.03 -0.01 -0.00 0.01 ]
C [ 0.01 0.01 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.06 0.07 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 ]
G [ 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.05 0.08 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.01 ]
T [ 0.01 -0.00 -0.00 0.02 0.14 0.13 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.01 ]

Frequency matrix

A [ 298 298 317 390 293 278 560 569 544 359 307 310 301 382 361 248 200 129 655 251 11 13 233 47 252 478 26 1245 1351 763 311 192 481 276 413 293 246 422 357 288 373 371 247 262 280 419 320 315 373 443 ]
C [ 244 504 387 233 257 252 253 245 259 252 286 422 473 413 347 417 405 668 253 340 13 5 1023 1159 485 46 19 51 15 214 296 528 296 481 330 263 285 324 444 418 253 378 391 579 558 325 362 363 372 350 ]
G [ 283 245 273 447 566 585 338 336 251 385 544 368 362 240 394 481 370 367 290 261 12 32 30 35 181 781 1263 40 5 320 181 475 322 390 380 404 455 303 273 215 234 239 264 259 275 264 322 348 260 248 ]
T [ 559 337 407 314 268 269 233 234 330 388 247 284 248 349 282 238 409 220 186 532 1348 1334 98 143 466 79 76 48 13 87 596 189 285 237 261 424 398 335 310 463 524 396 482 284 271 376 380 358 379 343 ]

Hypothetical CWM

A [ 0.01 -0.02 -0.01 -0.04 -0.04 0.02 -0.05 -0.09 -0.06 0.02 -0.06 -0.04 0.00 -0.05 0.11 0.14 0.05 -0.02 -0.02 0.02 -0.01 -0.01 -0.02 ]
C [ 0.01 0.01 0.00 0.03 0.03 -0.02 0.02 -0.06 -0.09 0.07 0.08 0.04 -0.03 -0.08 -0.05 -0.05 -0.03 0.02 0.03 0.01 0.03 0.02 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.03 -0.02 -0.05 -0.04 -0.08 -0.04 0.04 0.08 0.08 -0.07 -0.08 0.02 -0.02 0.03 0.03 0.01 0.02 0.01 ]
T [ -0.02 -0.00 -0.01 0.01 -0.01 -0.03 0.04 0.14 0.13 -0.04 -0.00 -0.03 -0.06 0.02 -0.05 -0.09 -0.06 0.02 -0.03 -0.05 -0.01 -0.02 0.01 ]

4 profiles found for the same TF (STAT1) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001062.1 STAT1 ENCSR000EHJ K562 Homo sapiens MA0137.4
BP001064.1 STAT1 ENCSR000EZK HeLa-S3 Homo sapiens MA0137.4
BP001065.1 STAT1 ENCSR000FAU K562 Homo sapiens MA0517.2
BP001066.1 STAT1 ENCSR000FAV K562 Homo sapiens MA0137.4
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