This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in astrocyte of the cerebellum using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
| Name: | CTCF |
| Model ID: | BP000076.1 |
| Cell line/tissue: | astrocyte of the cerebellum |
| Class: | C2H2 zinc finger factors |
| Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
| JASPAR ID: | MA0139.2 |
| Taxon: | Vertebrates |
| Species: | Homo sapiens |
| Data Type: | ChIP-seq |
| Uniprot ID: | P49711 |
| Source: | ENCSR000DSZ |
| Model: | BPNet |
| Download trained model | |
| Download TF-MoDISco Report |
| A [ | 0.01 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.01 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.04 | 0.00 | 0.09 | 0.14 | 0.05 | 0.07 | 0.16 | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | ] |
| G [ | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.03 | 0.00 | 0.07 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.05 | -0.00 | 0.16 | 0.09 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | ] |
| T [ | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.07 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.01 | -0.00 | -0.00 | ] |
| A [ | 4939 | 4654 | 4779 | 5242 | 5116 | 4918 | 4977 | 5104 | 4537 | 5045 | 4972 | 4308 | 4471 | 4032 | 5933 | 6679 | 3153 | 7983 | 3005 | 1962 | 2361 | 1848 | 716 | 5339 | 434 | 232 | 1529 | 7321 | 786 | 3794 | 294 | 1337 | 3903 | 4935 | 6982 | 5369 | 6170 | 5213 | 4764 | 4828 | 5293 | 4969 | 6081 | 8366 | 6095 | 4284 | 4844 | 4611 | 5777 | 5832 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 5384 | 5431 | 5485 | 5023 | 5151 | 5392 | 5530 | 5500 | 5411 | 4315 | 4212 | 5518 | 5478 | 7810 | 4914 | 5548 | 6203 | 2978 | 5471 | 9608 | 1778 | 15367 | 18749 | 11840 | 13447 | 19863 | 2380 | 1941 | 7385 | 3356 | 429 | 1661 | 8526 | 6346 | 3187 | 5067 | 4356 | 4734 | 4957 | 4497 | 3815 | 3366 | 4728 | 4578 | 5024 | 4805 | 3963 | 6817 | 6730 | 5135 | ] |
| G [ | 5112 | 5258 | 5105 | 5024 | 4966 | 4954 | 4929 | 5348 | 4844 | 6006 | 6716 | 6019 | 5331 | 4292 | 4268 | 4423 | 4807 | 6035 | 9411 | 2353 | 12261 | 2078 | 504 | 1155 | 308 | 148 | 605 | 7980 | 10739 | 1441 | 18864 | 15481 | 2524 | 4777 | 7276 | 5647 | 4934 | 5589 | 5633 | 6328 | 7098 | 8397 | 5093 | 3697 | 4285 | 4381 | 6419 | 5213 | 3910 | 4930 | ] |
| T [ | 5163 | 5255 | 5229 | 5309 | 5365 | 5334 | 5162 | 4646 | 5806 | 5232 | 4698 | 4753 | 5318 | 4464 | 5483 | 3948 | 6435 | 3602 | 2711 | 6675 | 4198 | 1305 | 629 | 2264 | 6409 | 355 | 16084 | 3356 | 1688 | 12007 | 1011 | 2119 | 5645 | 4540 | 3153 | 4515 | 5138 | 5062 | 5244 | 4945 | 4392 | 3866 | 4696 | 3957 | 5194 | 7128 | 5372 | 3957 | 4181 | 4701 | ] |
| A [ | 0.00 | 0.02 | -0.03 | 0.02 | -0.01 | -0.05 | -0.02 | -0.01 | -0.04 | 0.01 | -0.06 | -0.04 | -0.04 | 0.05 | -0.06 | -0.03 | -0.08 | -0.04 | -0.02 | -0.01 | 0.02 | 0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.01 | 0.02 | 0.02 | -0.00 | 0.03 | 0.10 | -0.02 | 0.11 | 0.15 | 0.09 | 0.12 | 0.16 | 0.03 | -0.02 | 0.04 | 0.06 | -0.03 | -0.02 | 0.05 | 0.04 | 0.00 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | ] |
| G [ | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.06 | -0.01 | 0.10 | -0.02 | -0.04 | -0.00 | -0.06 | -0.03 | -0.02 | 0.05 | 0.10 | -0.03 | 0.17 | 0.11 | -0.01 | 0.03 | 0.05 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | ] |
| T [ | 0.01 | -0.02 | 0.02 | -0.02 | -0.02 | 0.01 | -0.01 | -0.05 | -0.05 | -0.06 | 0.03 | -0.06 | 0.08 | -0.02 | -0.03 | 0.03 | -0.04 | -0.02 | 0.01 | -0.02 | -0.03 | -0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |