This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in fibroblast of dermis using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
| Name: | CTCF |
| Model ID: | BP000015.1 |
| Cell line/tissue: | fibroblast of dermis |
| Class: | C2H2 zinc finger factors |
| Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
| JASPAR ID: | MA0139.2 |
| Taxon: | Vertebrates |
| Species: | Homo sapiens |
| Data Type: | ChIP-seq |
| Uniprot ID: | P49711 |
| Source: | ENCSR000APM |
| Model: | BPNet |
| Download trained model | |
| Download TF-MoDISco Report |
| A [ | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.03 | -0.00 | -0.00 | 0.07 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.00 | 0.01 | 0.00 | -0.00 | 0.09 | 0.17 | -0.00 | 0.06 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.07 | 0.00 | 0.03 | 0.01 | 0.00 | -0.00 | ] |
| G [ | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | 0.17 | 0.07 | 0.05 | 0.14 | 0.09 | 0.00 | 0.04 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |
| T [ | 0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.01 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.01 | ] |
| A [ | 4722 | 4109 | 3961 | 5410 | 6895 | 5066 | 3854 | 4679 | 3837 | 4361 | 4977 | 5315 | 4942 | 5111 | 4416 | 3182 | 4522 | 5541 | 2079 | 169 | 12866 | 1491 | 3532 | 15531 | 413 | 6385 | 2459 | 741 | 1439 | 4216 | 7029 | 2807 | 3662 | 6493 | 4065 | 5592 | 4482 | 5186 | 4659 | 4765 | 5225 | 5824 | 4662 | 5010 | 5189 | 5382 | 5256 | 5156 | 5195 | 5156 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 4960 | 3836 | 5335 | 6444 | 4449 | 4266 | 3681 | 5093 | 8278 | 7168 | 6341 | 5587 | 5459 | 4844 | 5991 | 7096 | 4699 | 2519 | 15559 | 20137 | 1248 | 10527 | 7723 | 608 | 134 | 265 | 993 | 504 | 2062 | 12084 | 2517 | 9051 | 6180 | 4746 | 4317 | 4207 | 4215 | 5372 | 6212 | 6906 | 5942 | 4657 | 5381 | 4916 | 4878 | 4889 | 4913 | 5010 | 5225 | 5058 | ] |
| G [ | 5023 | 6669 | 6646 | 3791 | 4792 | 4886 | 4616 | 4705 | 3435 | 3803 | 4428 | 4802 | 4600 | 4249 | 4891 | 3137 | 6397 | 8393 | 1468 | 68 | 2306 | 7581 | 1922 | 2571 | 19607 | 13290 | 11549 | 18299 | 14913 | 1705 | 9025 | 5497 | 3071 | 6009 | 5516 | 4828 | 7628 | 5491 | 5263 | 3937 | 4147 | 5445 | 5345 | 5529 | 5378 | 4967 | 5010 | 5531 | 5435 | 5326 | ] |
| T [ | 5733 | 5824 | 4496 | 4793 | 4302 | 6220 | 8287 | 5961 | 4888 | 5106 | 4692 | 4734 | 5437 | 6234 | 5140 | 7023 | 4820 | 3985 | 1332 | 64 | 4018 | 839 | 7261 | 1728 | 284 | 498 | 5437 | 894 | 2024 | 2433 | 1867 | 3083 | 7525 | 3190 | 6540 | 5811 | 4113 | 4389 | 4304 | 4830 | 5124 | 4512 | 5050 | 4983 | 4993 | 5200 | 5259 | 4741 | 4583 | 4898 | ] |
| A [ | 0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.02 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | -0.03 | 0.04 | -0.02 | -0.01 | 0.09 | -0.05 | 0.05 | -0.05 | -0.05 | -0.04 | -0.01 | 0.02 | -0.02 | -0.01 | 0.03 | -0.01 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.06 | 0.03 | -0.01 | 0.12 | 0.18 | -0.02 | 0.11 | 0.05 | -0.01 | -0.02 | -0.06 | -0.00 | -0.03 | -0.02 | 0.10 | -0.01 | 0.06 | 0.04 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | ] |
| G [ | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | -0.00 | 0.04 | 0.05 | -0.03 | -0.03 | 0.07 | 0.05 | -0.01 | 0.03 | 0.17 | 0.12 | 0.10 | 0.15 | 0.11 | -0.01 | 0.11 | 0.04 | -0.00 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.03 | 0.01 | ] |
| T [ | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | -0.00 | -0.01 | -0.04 | -0.07 | -0.01 | -0.05 | 0.06 | -0.02 | -0.04 | -0.06 | 0.01 | -0.03 | 0.00 | -0.02 | -0.05 | -0.01 | 0.03 | -0.03 | 0.02 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | ] |
