Detailed information of deep learning profile BP001279.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZKSCAN8 in WTC11 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: ZKSCAN8
Model ID: BP001279.1
Cell line/tissue: WTC11
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0592.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q15776  
Source: ENCSR115QIT
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 0.01 -0.00 0.02 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 0.01 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.03 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.02 0.04 -0.00 0.04 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 182 213 348 245 238 398 220 419 264 223 228 109 147 192 196 59 54 985 106 813 18 973 83 70 801 133 27 63 164 18 71 105 843 747 37 732 723 618 54 123 81 215 143 321 187 177 236 338 352 216 ]
C [ 402 312 218 226 378 283 452 216 167 231 162 559 562 272 71 31 618 33 405 48 977 44 67 301 79 17 5 394 4 966 250 649 138 112 72 101 137 66 98 68 642 212 235 169 313 213 228 262 237 213 ]
G [ 229 205 263 398 229 204 218 215 521 298 508 211 146 176 527 965 34 37 47 168 22 30 895 58 54 920 1036 19 906 19 21 52 58 151 51 140 101 216 95 846 79 110 287 462 174 229 408 249 234 260 ]
T [ 268 351 252 212 236 196 191 231 129 329 183 202 226 441 287 26 375 26 523 52 64 34 36 652 147 11 13 605 7 78 739 275 42 71 921 108 120 181 834 44 279 544 416 129 407 462 209 232 258 392 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.01 0.02 0.01 0.02 -0.01 0.02 0.00 -0.01 0.01 -0.00 -0.01 -0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.00 0.02 0.01 -0.01 0.01 0.00 0.01 -0.02 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.02 0.01 -0.01 -0.00 -0.02 0.03 -0.01 -0.02 0.00 -0.01 -0.00 -0.03 0.04 -0.04 0.03 0.00 0.01 -0.01 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.01 -0.00 0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.02 0.00 -0.02 0.01 -0.02 -0.00 0.02 -0.01 -0.01 0.02 0.04 -0.04 0.05 -0.02 -0.00 -0.01 -0.00 -0.02 -0.02 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.02 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.01 0.01 -0.02 0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 0.02 0.01 -0.02 -0.01 0.01 -0.02 -0.00 0.01 0.00 -0.01 0.00 0.03 -0.01 -0.00 0.01 0.02 -0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 418

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 106

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_5

Num. of seqlets: 29

CWM

PFM

     

HCWM

2 profiles found for the same TF (ZKSCAN8) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001280.1 ZKSCAN8 ENCSR448UKK K562 Homo sapiens UN0592.2
BP001281.1 ZKSCAN8 ENCSR755CRA K562 Homo sapiens UN0592.2
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