Detailed information of deep learning profile BP001279.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZKSCAN8 in WTC11 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: ZKSCAN8
Model ID: BP001279.1
Cell line/tissue: WTC11
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0592.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q15776  
Source: ENCSR115QIT
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.04 0.02 -0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.03 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.01 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.02 -0.00 0.01 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 392 258 232 209 462 407 129 416 544 279 44 834 181 120 108 921 71 42 275 739 78 7 605 13 11 147 652 36 34 64 52 523 26 375 26 287 441 226 202 183 329 129 231 191 196 236 212 252 351 268 ]
C [ 260 234 249 408 229 174 462 287 110 79 846 95 216 101 140 51 151 58 52 21 19 906 19 1036 920 54 58 895 30 22 168 47 37 34 965 527 176 146 211 508 298 521 215 218 204 229 398 263 205 229 ]
G [ 213 237 262 228 213 313 169 235 212 642 68 98 66 137 101 72 112 138 649 250 966 4 394 5 17 79 301 67 44 977 48 405 33 618 31 71 272 562 559 162 231 167 216 452 283 378 226 218 312 402 ]
T [ 216 352 338 236 177 187 321 143 215 81 123 54 618 723 732 37 747 843 105 71 18 164 63 27 133 801 70 83 973 18 813 106 985 54 59 196 192 147 109 228 223 264 419 220 398 238 245 348 213 182 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.02 0.01 -0.00 -0.01 0.03 0.00 -0.01 0.00 0.01 -0.00 -0.02 0.01 -0.01 -0.02 0.01 0.02 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 0.02 -0.02 0.01 -0.01 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.02 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.02 -0.02 -0.00 -0.01 -0.00 -0.02 0.05 -0.04 0.04 0.02 -0.01 -0.01 0.02 -0.00 -0.02 0.01 -0.02 0.00 -0.02 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
G [ -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.01 0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.01 0.01 0.00 0.03 -0.04 0.04 -0.03 -0.00 -0.01 0.00 -0.02 -0.01 0.03 -0.02 -0.00 -0.01 0.01 -0.02 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ 0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.02 0.01 0.00 0.01 -0.01 0.01 0.02 0.00 -0.01 -0.01 0.01 -0.01 -0.01 -0.00 0.01 -0.01 0.00 0.02 -0.01 0.02 0.01 0.02 -0.01 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 418

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 106

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_5

Num. of seqlets: 29

CWM

PFM

     

HCWM

2 profiles found for the same TF (ZKSCAN8) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001280.1 ZKSCAN8 ENCSR448UKK K562 Homo sapiens UN0592.2
BP001281.1 ZKSCAN8 ENCSR755CRA K562 Homo sapiens UN0592.2
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