Detailed information of deep learning profile BP001234.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF317 in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: ZNF317
Model ID: BP001234.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1593.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q96PQ6  
Source: ENCSR976MXN
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.01 0.03 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.09 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.02 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.16 0.00 -0.00 0.08 0.00 -0.00 0.00 0.06 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.02 -0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 -0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.07 0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.06 -0.00 -0.00 0.10 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 0.00 ]
T [ -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.03 0.02 0.02 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 2458 2420 2186 1167 1197 2115 2302 1730 1615 1449 1159 1659 2701 668 2123 2942 522 3230 1305 780 2157 3535 13 3527 643 446 1980 303 4239 60 966 569 606 438 552 2401 923 628 2707 865 2915 3084 2930 707 1503 1938 520 1465 990 2865 ]
C [ 614 501 488 470 473 458 493 1241 892 1438 1879 1146 387 529 961 507 150 175 1319 240 165 60 4318 124 144 3589 316 56 30 2309 672 338 2320 546 2357 447 585 2300 338 341 467 357 503 2498 1184 1010 373 344 1430 426 ]
G [ 579 838 1031 2090 2077 1232 814 614 1099 618 558 823 739 558 552 536 3520 565 601 568 1638 344 5 229 3386 94 292 3847 49 35 158 232 277 342 424 768 1444 513 725 2686 579 576 486 337 484 471 536 2024 1377 580 ]
T [ 747 639 693 671 651 593 789 813 792 893 802 770 571 2643 762 413 206 428 1173 2810 438 459 62 518 225 269 1810 192 80 1994 2602 3259 1195 3072 1065 782 1446 957 628 506 437 381 479 856 1227 979 2969 565 601 527 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 0.00 0.03 0.01 -0.01 0.03 0.01 0.00 0.02 0.04 -0.04 0.01 0.02 0.02 -0.00 -0.00 0.09 -0.04 0.02 0.02 0.01 0.00 0.00 0.01 0.01 -0.00 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 -0.00 0.01 0.03 -0.02 -0.01 0.00 0.00 ]
C [ 0.02 0.01 0.01 -0.01 0.06 0.00 0.00 0.03 0.01 -0.02 -0.02 0.16 0.01 -0.01 0.10 0.06 -0.03 -0.04 0.12 -0.01 -0.01 0.02 0.04 0.03 0.01 0.03 0.05 0.02 0.01 0.03 0.01 0.01 0.04 -0.01 -0.00 0.02 0.00 0.01 0.02 ]
G [ 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.08 0.02 0.02 0.04 0.07 -0.00 -0.04 0.04 0.08 -0.02 -0.01 0.11 -0.04 -0.05 0.02 0.02 0.01 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 0.04 0.02 0.03 0.01 -0.00 0.03 -0.00 0.00 0.05 0.04 0.02 ]
T [ 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.01 0.02 0.00 0.02 0.02 0.01 -0.01 -0.00 0.03 0.01 -0.01 0.07 0.03 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.02 -0.00 0.05 0.01 0.00 0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 1752

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 894

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 250

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 191

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_5

Num. of seqlets: 189

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_6

Num. of seqlets: 146

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_7

Num. of seqlets: 96

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_11

Num. of seqlets: 38

CWM

PFM

     

HCWM

2 profiles found for the same TF (ZNF317) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001232.1 ZNF317 ENCSR016OHL HepG2 Homo sapiens MA1593.2
BP001233.1 ZNF317 ENCSR795KRU WTC11 Homo sapiens MA1593.2
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