Detailed information of deep learning profile BP001234.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF317 in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: ZNF317
Model ID: BP001234.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1593.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q96PQ6  
Source: ENCSR976MXN
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.02 0.02 0.03 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 ]
C [ 0.00 0.01 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.10 -0.00 -0.00 0.06 0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.07 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.06 0.00 -0.00 0.00 0.08 -0.00 0.00 0.16 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 0.02 0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.09 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.03 0.01 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 527 601 565 2969 979 1227 856 479 381 437 506 628 957 1446 782 1065 3072 1195 3259 2602 1994 80 192 1810 269 225 518 62 459 438 2810 1173 428 206 413 762 2643 571 770 802 893 792 813 789 593 651 671 693 639 747 ]
C [ 580 1377 2024 536 471 484 337 486 576 579 2686 725 513 1444 768 424 342 277 232 158 35 49 3847 292 94 3386 229 5 344 1638 568 601 565 3520 536 552 558 739 823 558 618 1099 614 814 1232 2077 2090 1031 838 579 ]
G [ 426 1430 344 373 1010 1184 2498 503 357 467 341 338 2300 585 447 2357 546 2320 338 672 2309 30 56 316 3589 144 124 4318 60 165 240 1319 175 150 507 961 529 387 1146 1879 1438 892 1241 493 458 473 470 488 501 614 ]
T [ 2865 990 1465 520 1938 1503 707 2930 3084 2915 865 2707 628 923 2401 552 438 606 569 966 60 4239 303 1980 446 643 3527 13 3535 2157 780 1305 3230 522 2942 2123 668 2701 1659 1159 1449 1615 1730 2302 2115 1197 1167 2186 2420 2458 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.01 0.00 0.01 0.05 -0.00 0.02 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.02 0.03 0.07 -0.01 0.01 0.03 -0.00 -0.01 0.01 0.02 0.02 0.00 0.02 0.01 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 0.01 0.00 0.00 ]
C [ 0.02 0.04 0.05 0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.01 0.03 0.02 0.04 0.03 0.02 0.02 0.03 0.03 0.02 0.01 0.02 0.02 -0.05 -0.04 0.11 -0.01 -0.02 0.08 0.04 -0.04 -0.00 0.07 0.04 0.02 0.02 0.08 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 ]
G [ 0.02 0.01 0.00 0.02 -0.00 -0.01 0.04 0.01 0.01 0.03 0.01 0.02 0.05 0.03 0.01 0.03 0.04 0.02 -0.01 -0.01 0.12 -0.04 -0.03 0.06 0.10 -0.01 0.01 0.16 -0.02 -0.02 0.01 0.03 0.00 0.00 0.06 -0.01 0.01 0.01 0.02 ]
T [ 0.00 0.00 -0.01 -0.02 0.03 0.01 -0.00 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 -0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.02 0.02 -0.04 0.09 -0.00 -0.00 0.02 0.02 0.01 -0.04 0.04 0.02 0.00 0.01 0.03 -0.01 0.01 0.03 0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 1752

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 894

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 250

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 191

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_5

Num. of seqlets: 189

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_6

Num. of seqlets: 146

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_7

Num. of seqlets: 96

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_11

Num. of seqlets: 38

CWM

PFM

     

HCWM

2 profiles found for the same TF (ZNF317) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001232.1 ZNF317 ENCSR016OHL HepG2 Homo sapiens MA1593.2
BP001233.1 ZNF317 ENCSR795KRU WTC11 Homo sapiens MA1593.2
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