This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for USF1 in Ishikawa using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
| Name: | USF1 |
| Model ID: | BP000639.1 |
| Cell line/tissue: | Ishikawa |
| Class: | Basic helix-loop-helix factors (bHLH) |
| Family: | bHLH-ZIP |
| JASPAR ID: | MA0093.4 |
| Taxon: | Vertebrates |
| Species: | Homo sapiens |
| Data Type: | ChIP-seq |
| Uniprot ID: | P22415 |
| Source: | ENCSR000BSX |
| Model: | BPNet |
| Download trained model | |
| Download TF-MoDISco Report |
| A [ | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.08 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.03 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.11 | -0.00 | 0.05 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.03 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |
| G [ | 0.00 | 0.01 | 0.02 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.08 | -0.00 | 0.11 | 0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |
| T [ | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.00 | 0.09 | 0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |
| A [ | 3027 | 3469 | 2954 | 2858 | 3020 | 3422 | 2974 | 2814 | 3055 | 4013 | 3460 | 3328 | 2915 | 3234 | 2904 | 3204 | 3894 | 1512 | 38 | 14595 | 40 | 193 | 30 | 18 | 10667 | 480 | 2153 | 3446 | 3878 | 3308 | 2717 | 2629 | 2707 | 3258 | 3651 | 3001 | 2652 | 3617 | 5032 | 4219 | 3086 | 3442 | 4020 | 3724 | 3738 | 3292 | 3242 | 3158 | 3650 | 3460 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 4725 | 4201 | 4090 | 3959 | 4124 | 4054 | 4511 | 4848 | 4789 | 4169 | 3840 | 4426 | 4575 | 4167 | 3552 | 3047 | 2781 | 5635 | 15300 | 218 | 7554 | 546 | 67 | 20 | 1611 | 10579 | 6530 | 4862 | 4106 | 4277 | 4394 | 5143 | 4690 | 3901 | 3792 | 4773 | 6045 | 5349 | 3864 | 3858 | 3954 | 4294 | 3986 | 3969 | 4069 | 3889 | 3917 | 4273 | 3893 | 4069 | ] |
| G [ | 4255 | 3961 | 3775 | 4409 | 4798 | 5108 | 4546 | 3875 | 3783 | 4305 | 5260 | 4819 | 4086 | 4690 | 4600 | 7068 | 7557 | 2504 | 28 | 278 | 1653 | 14624 | 40 | 15326 | 2468 | 1360 | 2171 | 3392 | 4431 | 4764 | 4282 | 3753 | 3882 | 4721 | 5166 | 4712 | 3567 | 3527 | 3730 | 3743 | 4233 | 4600 | 4513 | 4681 | 3999 | 4664 | 4410 | 4402 | 4338 | 4580 | ] |
| T [ | 3368 | 3744 | 4556 | 4149 | 3433 | 2791 | 3344 | 3838 | 3748 | 2888 | 2815 | 2802 | 3799 | 3284 | 4319 | 2056 | 1143 | 5724 | 9 | 284 | 6128 | 12 | 15238 | 11 | 629 | 2956 | 4521 | 3675 | 2960 | 3026 | 3982 | 3850 | 4096 | 3495 | 2766 | 2889 | 3111 | 2882 | 2749 | 3555 | 4102 | 3039 | 2856 | 3001 | 3569 | 3530 | 3806 | 3542 | 3494 | 3266 | ] |
| A [ | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.01 | -0.02 | 0.08 | -0.08 | 0.02 | -0.03 | -0.05 | 0.05 | -0.03 | -0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.00 | 0.01 | 0.11 | -0.02 | 0.09 | -0.00 | -0.01 | -0.05 | 0.00 | 0.05 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | ] |
| G [ | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | 0.04 | 0.00 | -0.05 | 0.00 | -0.01 | 0.09 | -0.02 | 0.11 | 0.01 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | ] |
| T [ | 0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.02 | 0.04 | -0.05 | -0.03 | 0.02 | -0.08 | 0.09 | -0.02 | -0.02 | 0.02 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |
