This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for USF1 in A549 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
Name: | USF1 |
Model ID: | BP000633.1 |
Cell line/tissue: | A549 |
Class: | Basic helix-loop-helix factors (bHLH) |
Family: | bHLH-ZIP |
JASPAR ID: | MA0093.4 |
Taxon: | Vertebrates |
Species: | Homo sapiens |
Data Type: | ChIP-seq |
Uniprot ID: | P22415 |
Source: | ENCSR000BHX |
Model: | BPNet |
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A [ | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.11 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.14 | -0.00 | 0.10 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | 0.00 | ] |
G [ | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.04 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.07 | -0.00 | 0.13 | 0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |
T [ | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.04 | 0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.08 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |
A [ | 1796 | 1571 | 1424 | 1509 | 2045 | 1867 | 1422 | 1417 | 1531 | 1465 | 1393 | 1721 | 2060 | 1811 | 1989 | 1520 | 1437 | 1774 | 2437 | 1377 | 291 | 5 | 7662 | 3 | 2625 | 114 | 5 | 2239 | 649 | 1033 | 2128 | 1409 | 1753 | 1403 | 1404 | 1451 | 1896 | 1943 | 1688 | 1480 | 1642 | 2021 | 2232 | 1892 | 1696 | 1771 | 1702 | 1793 | 1715 | 1597 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 1984 | 2264 | 2246 | 2293 | 2086 | 1837 | 1753 | 1746 | 1727 | 2315 | 2595 | 2410 | 1942 | 1990 | 2128 | 2431 | 2170 | 1595 | 1031 | 397 | 906 | 7667 | 4 | 6880 | 353 | 167 | 17 | 1434 | 3205 | 3522 | 2081 | 2513 | 2103 | 2477 | 2642 | 2058 | 1858 | 1874 | 2248 | 2442 | 2385 | 2202 | 1895 | 1921 | 2173 | 1993 | 2033 | 1927 | 1909 | 2054 | ] |
G [ | 1977 | 1924 | 2018 | 2168 | 2033 | 1829 | 2002 | 2652 | 3020 | 2380 | 1913 | 1926 | 2335 | 2506 | 2099 | 2059 | 2002 | 2636 | 3278 | 5825 | 578 | 11 | 13 | 303 | 4696 | 102 | 7648 | 3174 | 1624 | 1752 | 2008 | 2103 | 2304 | 2194 | 1820 | 2145 | 2380 | 2367 | 2244 | 2026 | 2037 | 1965 | 2032 | 2049 | 2263 | 2436 | 2352 | 2263 | 2449 | 2384 | ] |
T [ | 1926 | 1924 | 1995 | 1713 | 1519 | 2150 | 2506 | 1868 | 1405 | 1523 | 1782 | 1626 | 1346 | 1376 | 1467 | 1673 | 2074 | 1678 | 937 | 84 | 5908 | 0 | 4 | 497 | 9 | 7300 | 13 | 836 | 2205 | 1376 | 1466 | 1658 | 1523 | 1609 | 1817 | 2029 | 1549 | 1499 | 1503 | 1735 | 1619 | 1495 | 1524 | 1821 | 1551 | 1483 | 1596 | 1700 | 1610 | 1648 | ] |
A [ | 0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.03 | -0.02 | -0.03 | 0.11 | -0.09 | 0.02 | -0.02 | -0.06 | 0.04 | -0.03 | -0.01 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | -0.01 | 0.01 | 0.14 | -0.04 | 0.11 | -0.03 | 0.01 | -0.05 | 0.01 | 0.04 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | ] |
G [ | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.06 | -0.00 | -0.05 | 0.01 | -0.02 | 0.11 | -0.04 | 0.13 | 0.01 | 0.00 | 0.02 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | ] |
T [ | -0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.01 | -0.04 | 0.06 | -0.06 | -0.04 | 0.02 | -0.08 | 0.09 | -0.03 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |