This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for USF1 in HepG2 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
| Name: | USF1 |
| Model ID: | BP000632.1 |
| Cell line/tissue: | HepG2 |
| Class: | Basic helix-loop-helix factors (bHLH) |
| Family: | bHLH-ZIP |
| JASPAR ID: | MA0093.4 |
| Taxon: | Vertebrates |
| Species: | Homo sapiens |
| Data Type: | ChIP-seq |
| Uniprot ID: | P22415 |
| Source: | ENCSR000BGM |
| Model: | BPNet |
| Download trained model | |
| Download TF-MoDISco Report |
| A [ | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.12 | 0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.15 | -0.00 | 0.11 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | 0.00 | ] |
| G [ | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.05 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.08 | -0.00 | 0.15 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |
| T [ | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.05 | 0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.09 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |
| A [ | 4998 | 5055 | 5267 | 5421 | 5165 | 5189 | 4629 | 4399 | 4784 | 5712 | 5199 | 4445 | 4419 | 4683 | 4405 | 4401 | 4915 | 5486 | 5535 | 5358 | 4560 | 4788 | 5901 | 6154 | 4300 | 986 | 4 | 21787 | 14 | 7424 | 532 | 11 | 5473 | 2224 | 3003 | 6268 | 4773 | 5277 | 4354 | 4403 | 4567 | 5241 | 5499 | 5104 | 4425 | 4933 | 5728 | 6155 | 5310 | 4907 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 6161 | 5864 | 5984 | 5909 | 6187 | 5428 | 6297 | 6057 | 6019 | 5741 | 5368 | 5242 | 5047 | 5059 | 6177 | 6840 | 6455 | 5735 | 5625 | 6337 | 6593 | 6022 | 4521 | 2578 | 1285 | 3162 | 21845 | 37 | 20011 | 999 | 374 | 9 | 3926 | 8300 | 9671 | 6176 | 6431 | 5535 | 6267 | 6711 | 5616 | 5245 | 5265 | 5983 | 6651 | 6334 | 5923 | 5322 | 5635 | 6050 | ] |
| G [ | 5775 | 5740 | 5932 | 5654 | 5644 | 5922 | 5668 | 5722 | 6172 | 5925 | 5556 | 5676 | 7027 | 7923 | 6729 | 5558 | 5547 | 6354 | 6635 | 5786 | 5897 | 5856 | 6651 | 9934 | 15748 | 1722 | 9 | 21 | 703 | 13400 | 421 | 21775 | 9718 | 4697 | 4997 | 5014 | 5727 | 6238 | 6458 | 5738 | 6150 | 6712 | 6721 | 6298 | 5777 | 5809 | 5704 | 6001 | 5952 | 6302 | ] |
| T [ | 4931 | 5206 | 4682 | 4881 | 4869 | 5326 | 5271 | 5687 | 4890 | 4487 | 5742 | 6502 | 5372 | 4200 | 4554 | 5066 | 4948 | 4290 | 4070 | 4384 | 4815 | 5199 | 4792 | 3199 | 532 | 15995 | 7 | 20 | 1137 | 42 | 20538 | 70 | 2748 | 6644 | 4194 | 4407 | 4934 | 4815 | 4786 | 5013 | 5532 | 4667 | 4380 | 4480 | 5012 | 4789 | 4510 | 4387 | 4968 | 4606 | ] |
| A [ | 0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.03 | -0.02 | -0.03 | 0.12 | -0.10 | 0.03 | -0.02 | -0.06 | 0.05 | -0.03 | -0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | -0.01 | 0.02 | 0.15 | -0.04 | 0.12 | -0.03 | -0.00 | -0.07 | 0.00 | 0.05 | 0.03 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | ] |
| G [ | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.06 | -0.00 | -0.06 | -0.01 | -0.01 | 0.12 | -0.04 | 0.15 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.02 | 0.01 | ] |
| T [ | 0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.01 | -0.04 | 0.06 | -0.06 | -0.03 | 0.03 | -0.11 | 0.10 | -0.02 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | 0.00 | -0.00 | 0.00 | ] |
