This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in D721Med using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
Name: | CTCF |
Model ID: | BP000051.1 |
Cell line/tissue: | D721Med |
Class: | C2H2 zinc finger factors |
Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
JASPAR ID: | MA0139.2 |
Taxon: | Vertebrates |
Species: | Homo sapiens |
Data Type: | ChIP-seq |
Uniprot ID: | P49711 |
Source: | ENCSR000DMY |
Model: | BPNet |
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A [ | 0.01 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.01 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.01 | 0.07 | -0.00 | 0.15 | 0.21 | 0.07 | 0.09 | 0.23 | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | ] |
G [ | 0.00 | 0.01 | 0.02 | 0.05 | -0.00 | 0.12 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.06 | -0.00 | 0.20 | 0.10 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | ] |
T [ | -0.01 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.01 | 0.02 | -0.00 | 0.09 | -0.01 | -0.00 | 0.03 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.01 | -0.01 | -0.00 | ] |
A [ | 5319 | 5354 | 5313 | 5020 | 5187 | 5921 | 5719 | 5317 | 5477 | 5565 | 4817 | 5778 | 5495 | 4539 | 4697 | 4199 | 6732 | 7985 | 2756 | 9484 | 2649 | 1390 | 2044 | 1908 | 358 | 7205 | 253 | 218 | 1921 | 8025 | 1049 | 3955 | 464 | 1917 | 4170 | 5493 | 7543 | 5747 | 6426 | 5697 | 5316 | 5145 | 5789 | 5518 | 6459 | 8374 | 6671 | 4892 | 5286 | 5150 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 5802 | 5689 | 5652 | 5826 | 5953 | 5190 | 5140 | 5793 | 5897 | 5880 | 5735 | 3821 | 3616 | 5706 | 5878 | 8996 | 4792 | 5700 | 6289 | 2128 | 5912 | 10888 | 933 | 18603 | 21255 | 12355 | 13902 | 21372 | 2438 | 2187 | 8154 | 3294 | 614 | 2113 | 8995 | 6653 | 3780 | 5448 | 4781 | 5050 | 5180 | 4936 | 4338 | 4037 | 5072 | 5194 | 5214 | 5223 | 4492 | 6766 | ] |
G [ | 5609 | 5375 | 5381 | 5602 | 5257 | 5176 | 5077 | 5079 | 5127 | 5874 | 4833 | 6909 | 8187 | 6922 | 5796 | 4176 | 4219 | 4572 | 5431 | 7252 | 11450 | 1408 | 15485 | 1012 | 133 | 790 | 194 | 100 | 650 | 8112 | 10833 | 1711 | 19907 | 15382 | 2962 | 4894 | 7065 | 5867 | 5290 | 5840 | 6141 | 6637 | 7228 | 8054 | 5431 | 4133 | 4647 | 4856 | 6363 | 5643 | ] |
T [ | 5395 | 5707 | 5779 | 5677 | 5728 | 5838 | 6189 | 5936 | 5624 | 4806 | 6740 | 5617 | 4827 | 4958 | 5754 | 4754 | 6382 | 3868 | 7649 | 3261 | 2114 | 8439 | 3663 | 602 | 379 | 1775 | 7776 | 435 | 17116 | 3801 | 2089 | 13165 | 1140 | 2713 | 5998 | 5085 | 3737 | 5063 | 5628 | 5538 | 5488 | 5407 | 4770 | 4516 | 5163 | 4424 | 5593 | 7154 | 5984 | 4566 | ] |
A [ | -0.01 | -0.01 | 0.01 | 0.04 | -0.06 | 0.04 | -0.02 | -0.08 | -0.03 | 0.01 | -0.04 | 0.04 | -0.09 | -0.04 | -0.03 | 0.07 | -0.07 | -0.02 | -0.09 | -0.04 | -0.02 | -0.01 | 0.02 | 0.00 | 0.01 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.02 | 0.05 | 0.00 | 0.03 | 0.03 | -0.02 | 0.05 | 0.17 | -0.02 | 0.17 | 0.22 | 0.14 | 0.17 | 0.23 | 0.03 | -0.00 | 0.06 | 0.08 | -0.03 | -0.02 | 0.07 | 0.05 | 0.00 | 0.02 | 0.01 | ] |
G [ | 0.02 | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.06 | 0.10 | -0.03 | 0.17 | -0.02 | -0.04 | -0.01 | -0.08 | -0.04 | -0.00 | 0.06 | 0.14 | -0.01 | 0.22 | 0.13 | -0.01 | 0.04 | 0.05 | 0.02 | 0.01 | ] |
T [ | 0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.03 | 0.04 | -0.03 | -0.04 | 0.02 | -0.03 | -0.08 | -0.06 | -0.09 | 0.06 | -0.07 | 0.11 | -0.02 | -0.02 | 0.04 | -0.03 | -0.01 | 0.02 | -0.02 | -0.03 | -0.00 | 0.00 | ] |