Detailed information of deep learning profile BP001291.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZFP1 in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: ZFP1
Model ID: BP001291.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0151.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q6P2D0  
Source: ENCSR617POJ
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.01 0.01 0.01 0.02 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.04 0.08 0.03 -0.00 -0.00 0.05 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.03 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.05 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.05 0.02 0.03 0.03 -0.00 0.06 0.00 -0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 775 409 306 346 260 256 836 717 279 287 476 825 287 964 819 59 196 67 109 1224 21 1192 146 15 59 1227 144 104 412 966 1108 1049 261 116 974 284 112 421 337 239 267 797 589 644 685 611 321 472 805 734 ]
C [ 231 376 261 199 344 644 216 222 668 697 337 182 202 145 253 40 61 446 215 40 55 81 1022 1424 1145 16 32 1237 418 280 67 100 851 61 67 205 1027 632 265 271 650 217 214 193 239 210 273 190 185 166 ]
G [ 219 192 172 402 212 243 182 305 173 164 183 222 702 204 122 46 57 53 73 188 36 41 93 9 19 38 1238 38 83 180 70 175 133 92 297 199 196 75 121 154 156 209 273 340 194 365 234 522 253 347 ]
T [ 270 518 756 548 679 352 261 251 375 347 499 266 304 182 301 1350 1181 929 1098 43 1383 181 234 47 272 214 81 116 582 69 250 171 250 1226 157 807 160 367 772 831 422 272 419 318 377 309 667 311 252 248 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.01 0.01 -0.02 -0.01 0.05 -0.03 0.04 0.01 -0.02 -0.02 0.03 0.01 -0.01 -0.01 0.02 0.01 0.03 0.00 -0.00 0.02 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 ]
C [ 0.00 0.01 -0.00 0.02 -0.02 -0.01 0.01 -0.01 -0.03 0.00 -0.01 0.05 0.08 0.04 -0.03 -0.03 0.06 0.01 0.02 -0.02 -0.00 0.03 -0.03 -0.01 0.00 0.05 0.02 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.01 -0.01 -0.03 0.00 -0.02 -0.02 -0.02 0.05 -0.03 0.01 -0.00 0.00 -0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.05 0.03 0.04 0.04 -0.03 0.06 -0.00 -0.03 -0.01 0.03 0.02 -0.01 0.00 0.03 -0.02 0.01 -0.01 -0.01 0.03 -0.00 0.02 -0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 286

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 271

CWM

PFM

     

HCWM

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Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001290.1 ZFP1 ENCSR586DEH HepG2 Homo sapiens UN0151.2
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