Detailed information of deep learning profile BP001291.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZFP1 in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: ZFP1
Model ID: BP001291.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0151.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q6P2D0  
Source: ENCSR617POJ
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.00 0.06 -0.00 0.03 0.03 0.02 0.05 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.05 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.03 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.05 -0.00 -0.00 0.03 0.08 0.04 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.02 0.01 0.01 -0.01 -0.00 0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 0.04 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 248 252 311 667 309 377 318 419 272 422 831 772 367 160 807 157 1226 250 171 250 69 582 116 81 214 272 47 234 181 1383 43 1098 929 1181 1350 301 182 304 266 499 347 375 251 261 352 679 548 756 518 270 ]
C [ 347 253 522 234 365 194 340 273 209 156 154 121 75 196 199 297 92 133 175 70 180 83 38 1238 38 19 9 93 41 36 188 73 53 57 46 122 204 702 222 183 164 173 305 182 243 212 402 172 192 219 ]
G [ 166 185 190 273 210 239 193 214 217 650 271 265 632 1027 205 67 61 851 100 67 280 418 1237 32 16 1145 1424 1022 81 55 40 215 446 61 40 253 145 202 182 337 697 668 222 216 644 344 199 261 376 231 ]
T [ 734 805 472 321 611 685 644 589 797 267 239 337 421 112 284 974 116 261 1049 1108 966 412 104 144 1227 59 15 146 1192 21 1224 109 67 196 59 819 964 287 825 476 287 279 717 836 256 260 346 306 409 775 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.01 0.02 -0.00 0.03 -0.01 -0.01 0.01 -0.02 0.03 0.00 -0.01 0.02 0.03 -0.01 -0.03 -0.00 0.06 -0.03 0.04 0.04 0.03 0.05 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 -0.01 0.00 -0.00 0.01 -0.03 0.05 -0.02 -0.02 -0.02 0.00 -0.03 -0.01 0.01 0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.00 -0.01 -0.03 0.03 -0.00 -0.02 0.02 0.01 0.06 -0.03 -0.03 0.04 0.08 0.05 -0.01 0.00 -0.03 -0.01 0.01 -0.01 -0.02 0.02 -0.00 0.01 0.00 ]
T [ -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 0.02 -0.00 0.00 0.03 0.01 0.02 -0.01 -0.01 0.01 0.03 -0.02 -0.02 0.01 0.04 -0.03 0.05 -0.01 -0.02 0.01 -0.01 -0.00 0.01 -0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 286

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 271

CWM

PFM

     

HCWM

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Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001290.1 ZFP1 ENCSR586DEH HepG2 Homo sapiens UN0151.2
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