Detailed information of deep learning profile BP001253.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF8 in MCF-7 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: ZNF8
Model ID: BP001253.1
Cell line/tissue: MCF-7
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: MA1718.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P17098  
Source: ENCSR785UCD
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 0.02 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

A [ 31 35 41 121 25 130 144 141 24 140 138 152 69 3 19 1 0 1 1 171 2 138 2 0 4 167 1 125 8 147 138 4 15 9 168 150 3 164 3 7 167 3 15 12 148 15 8 83 130 11 ]
C [ 14 5 3 9 11 9 7 5 96 11 13 10 54 2 1 5 0 0 5 0 48 1 5 171 150 0 9 3 150 17 4 5 0 0 0 7 9 0 76 5 3 79 3 132 1 8 144 72 13 18 ]
G [ 13 117 118 19 12 18 16 15 14 8 12 8 2 6 150 0 169 171 0 1 2 34 1 0 0 4 3 23 2 6 26 5 157 162 1 13 0 5 9 3 0 6 17 5 15 145 4 8 19 8 ]
T [ 115 16 11 24 125 16 6 12 39 14 10 3 48 162 3 167 4 1 167 1 121 0 165 2 19 2 160 22 13 3 5 159 1 2 4 3 161 4 85 158 3 85 138 24 9 5 17 10 11 136 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 0.02 -0.02 0.01 0.00 -0.01 0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.01 0.01 0.01 -0.01 -0.00 -0.01 0.01 0.01 -0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.01 -0.02 -0.01 -0.02 0.02 -0.01 -0.01 0.03 0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.02 -0.01 -0.01 0.01 -0.02 -0.00 -0.01 -0.01 0.00 -0.01 0.01 0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.01 -0.00 -0.01 0.01 -0.00 -0.01 -0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.01 -0.01 0.01 0.02 -0.01 -0.01 -0.01 0.01 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.02 0.01 -0.01 0.00 0.00 -0.02 0.03 0.01 -0.02 -0.00 -0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.00 0.00 -0.01 ]
T [ -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.01 0.01 -0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.01 -0.01 0.00 -0.00 -0.01 -0.01 0.02 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.02 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.01 -0.02 -0.00 0.00 -0.02 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 0.00 ]

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Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001252.1 ZNF8 ENCSR325QLX SK-N-SH Homo sapiens MA1718.1
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