Detailed information of deep learning profile BP001253.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF8 in MCF-7 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: ZNF8
Model ID: BP001253.1
Cell line/tissue: MCF-7
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: MA1718.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P17098  
Source: ENCSR785UCD
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 ]
C [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.02 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.03 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

A [ 136 11 10 17 5 9 24 138 85 3 158 85 4 161 3 4 2 1 159 5 3 13 22 160 2 19 2 165 0 121 1 167 1 4 167 3 162 48 3 10 14 39 12 6 16 125 24 11 16 115 ]
C [ 8 19 8 4 145 15 5 17 6 0 3 9 5 0 13 1 162 157 5 26 6 2 23 3 4 0 0 1 34 2 1 0 171 169 0 150 6 2 8 12 8 14 15 16 18 12 19 118 117 13 ]
G [ 18 13 72 144 8 1 132 3 79 3 5 76 0 9 7 0 0 0 5 4 17 150 3 9 0 150 171 5 1 48 0 5 0 0 5 1 2 54 10 13 11 96 5 7 9 11 9 3 5 14 ]
T [ 11 130 83 8 15 148 12 15 3 167 7 3 164 3 150 168 9 15 4 138 147 8 125 1 167 4 0 2 138 2 171 1 1 0 1 19 3 69 152 138 140 24 141 144 130 25 121 41 35 31 ]

Hypothetical CWM

A [ 0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 -0.02 0.00 -0.00 -0.02 0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.02 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.02 -0.01 -0.01 -0.00 0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.01 -0.01 -0.00 0.01 -0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 ]
C [ -0.01 0.00 0.00 -0.01 0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.01 -0.01 0.01 -0.01 -0.00 -0.02 0.01 0.03 -0.02 0.00 0.00 -0.01 0.01 -0.02 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.02 0.01 -0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ -0.00 -0.01 -0.00 0.01 -0.01 -0.00 0.01 -0.01 0.01 -0.01 0.00 0.01 -0.01 0.00 -0.01 -0.01 -0.00 -0.02 0.01 -0.01 -0.01 0.02 -0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.03 -0.01 -0.01 0.02 -0.02 -0.01 -0.02 -0.01 0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 -0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.01 -0.01 0.01 -0.01 0.01 0.01 -0.01 -0.00 -0.01 0.01 0.01 -0.01 0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.01 0.00 0.01 -0.02 0.02 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]

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Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001252.1 ZNF8 ENCSR325QLX SK-N-SH Homo sapiens MA1718.1
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