Detailed information of deep learning profile BP001237.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF12 in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: ZNF12
Model ID: BP001237.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0161.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P17014  
Source: ENCSR041YBR
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.06 0.07 -0.00 0.03 0.04 0.02 0.00 0.02 0.00 ]
C [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 -0.00 0.07 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.07 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.01 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.08 0.00 -0.00 0.09 -0.00 0.00 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.05 -0.00 0.00 0.02 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 321 884 291 615 827 308 273 266 822 508 251 282 291 614 486 64 159 125 77 105 586 695 338 1499 1833 68 1509 1659 1392 646 1047 899 390 333 467 303 827 856 968 634 406 333 429 393 552 537 463 368 360 376 ]
C [ 255 388 263 314 203 175 568 551 335 412 484 358 448 448 181 32 1578 124 26 1676 125 82 128 19 44 1531 60 77 148 558 192 248 854 1108 1050 1000 470 335 349 599 388 508 425 503 387 287 323 491 399 521 ]
G [ 636 332 280 396 662 1239 358 251 294 797 739 341 349 365 361 1790 105 86 1768 27 160 1059 95 382 45 267 291 145 359 240 250 558 367 182 157 173 274 494 347 275 333 489 546 595 449 728 673 617 545 390 ]
T [ 731 339 1109 618 251 221 744 875 492 226 469 962 855 516 915 57 101 1608 72 135 1072 107 1382 43 21 77 83 62 44 499 454 238 332 320 269 467 372 258 279 435 816 613 543 452 555 391 484 467 639 656 ]

Hypothetical CWM

A [ 0.00 -0.01 0.00 0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.02 -0.00 -0.02 -0.01 -0.02 0.01 -0.00 -0.02 -0.01 -0.02 0.00 -0.01 0.01 0.03 -0.00 0.06 0.07 -0.05 0.03 0.04 0.02 0.00 0.03 0.00 -0.01 ]
C [ -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.01 0.01 0.00 0.00 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 -0.01 0.06 0.02 -0.05 0.08 -0.02 -0.02 0.02 -0.06 -0.01 0.08 -0.04 0.00 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.00 0.01 0.01 0.04 0.01 -0.00 0.01 0.03 0.03 0.02 0.01 -0.00 -0.02 0.09 -0.01 -0.04 0.09 -0.04 -0.00 0.05 -0.04 0.04 0.00 0.01 0.04 -0.01 0.02 -0.01 0.00 0.02 0.01 ]
T [ -0.00 0.01 -0.00 -0.01 -0.01 0.01 0.02 -0.01 -0.03 0.00 0.01 0.02 0.01 0.02 -0.03 -0.01 0.05 -0.02 0.00 0.03 -0.03 0.04 -0.04 -0.05 -0.02 -0.02 -0.02 -0.04 0.01 -0.02 -0.02 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 103

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Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001238.1 ZNF12 ENCSR711KBM HepG2 Homo sapiens UN0161.2
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