Detailed information of deep learning profile BP001213.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF146 in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: ZNF146
Model ID: BP001213.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0316.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q15072  
Source: ENCSR713IFY
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.05 -0.00 0.10 0.00 -0.00 0.09 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.02 0.06 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.08 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.08 0.07 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.05 0.09 0.00 0.00 0.09 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.03 0.07 0.03 0.07 0.06 -0.02 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.01 -0.00 0.11 -0.00 -0.00 0.12 -0.00 0.03 0.06 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 10421 1810 1942 11184 6458 842 720 841 9410 670 131 1633 368 20 42 63 79 531 13035 650 420 568 78 162 527 2545 11659 7 13567 2012 16 13555 28 34 18 53 12745 173 835 1130 479 3189 480 10247 978 11716 671 3052 713 6150 ]
C [ 1068 896 876 556 1386 8386 1375 9642 1421 592 6283 11476 3287 46 316 61 135 2528 240 629 80 93 13416 229 59 9636 116 40 70 379 96 26 801 89 13438 13319 247 1366 492 350 752 314 697 337 774 542 909 415 837 713 ]
G [ 1299 2335 8821 1276 999 695 381 353 1682 242 179 126 79 23 174 70 67 359 477 325 12428 13191 192 14 13226 44 2104 24 189 11436 23 248 165 57 23 26 622 206 9471 11798 369 9807 390 2750 1472 939 487 9604 782 6287 ]
T [ 1111 8858 2260 883 5056 3976 11423 3063 1386 12395 7306 664 10165 13810 13367 13705 13618 10481 147 12295 971 47 213 13494 87 1674 20 13828 73 72 13764 70 12905 13719 420 501 285 12154 3101 621 12299 589 12332 565 10675 702 11832 828 11567 749 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.01 0.02 -0.03 -0.01 -0.04 -0.03 -0.01 -0.04 0.03 -0.04 -0.01 0.05 -0.01 0.01 0.03 -0.01 0.07 -0.06 0.10 0.04 -0.07 0.09 -0.04 -0.00 -0.00 -0.01 0.02 -0.02 -0.01 0.00 0.00 0.01 ]
C [ 0.01 0.01 0.02 0.01 0.06 0.07 0.03 -0.02 0.04 -0.01 -0.02 0.13 0.02 0.06 0.05 0.04 0.08 0.02 -0.02 0.05 0.03 0.01 0.00 0.07 0.00 -0.00 0.05 -0.05 0.08 0.08 0.01 0.05 0.02 0.02 0.02 0.01 ]
G [ 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.00 -0.03 0.03 -0.00 -0.01 0.05 0.03 0.05 0.06 0.09 0.05 0.00 0.10 -0.05 0.09 -0.04 -0.00 0.05 -0.05 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.00 0.01 0.00 0.01 ]
T [ -0.00 0.00 -0.01 0.01 -0.00 -0.04 0.04 0.07 0.03 0.07 0.07 -0.02 0.00 0.02 0.01 -0.06 -0.00 0.04 -0.01 0.07 -0.06 0.11 -0.03 -0.04 0.12 -0.04 0.04 0.06 -0.01 -0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_3

Num. of seqlets: 87

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.neg_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 34

CWM

PFM

     

HCWM

2 profiles found for the same TF (ZNF146) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001212.1 ZNF146 ENCSR689YFA HEK293 Homo sapiens UN0316.1
BP001214.1 ZNF146 ENCSR957LTN HepG2 Homo sapiens UN0316.1
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