Detailed information of deep learning profile BP001184.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for THRA in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: THRA
Model ID: BP001184.1
Cell line/tissue: K562
Class: Nuclear receptors with C4 zinc fingers
Family: Thyroid hormone receptor-related factors (NR1)
JASPAR ID: MA1969.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P10827  
Source: ENCSR264CZJ
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.06 0.05 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.03 0.04 0.01 0.01 -0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 465 300 284 299 264 259 283 275 256 219 244 372 359 358 248 220 184 249 79 104 643 27 10 7 106 994 346 435 84 229 987 168 32 30 150 341 242 266 284 278 234 224 277 273 239 239 243 278 271 312 ]
C [ 287 326 334 453 390 331 273 350 523 388 480 381 427 393 484 443 478 442 117 94 54 1275 1285 296 724 36 242 211 141 90 167 982 1193 566 498 316 452 423 346 517 505 374 391 362 373 455 489 320 466 407 ]
G [ 288 374 417 296 284 437 511 296 288 272 252 321 219 287 261 248 284 427 47 1055 141 9 11 10 200 249 434 399 31 945 144 18 18 19 258 276 368 271 365 266 260 298 256 410 394 303 250 294 286 344 ]
T [ 278 318 283 270 380 291 251 397 251 439 342 244 313 280 325 407 372 200 1075 65 480 7 12 1005 288 39 296 273 1062 54 20 150 75 703 412 385 256 358 323 257 319 422 394 273 312 321 336 426 295 255 ]

Hypothetical CWM

A [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.02 -0.00 0.02 -0.01 -0.03 -0.06 -0.02 0.03 0.01 0.01 -0.02 -0.00 0.04 0.01 -0.03 -0.03 -0.01 0.00 -0.01 0.01 ]
C [ 0.00 0.01 0.01 -0.00 0.01 -0.01 -0.03 0.06 0.05 0.02 0.01 -0.03 -0.00 -0.01 0.02 -0.02 0.00 0.04 0.04 0.02 0.02 -0.01 0.01 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.01 0.01 -0.02 0.04 -0.01 -0.02 0.01 -0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 -0.03 0.04 0.00 -0.03 -0.00 -0.01 0.00 0.02 0.01 0.01 ]
T [ -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.03 -0.01 0.01 -0.03 -0.03 0.04 0.01 -0.02 0.00 -0.00 0.03 -0.01 -0.04 -0.03 -0.02 0.02 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 ]

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Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001185.1 THRA ENCSR551QJT HepG2 Homo sapiens MA1969.2
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