Detailed information of deep learning profile BP001184.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for THRA in K562 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: THRA
Model ID: BP001184.1
Cell line/tissue: K562
Class: Nuclear receptors with C4 zinc fingers
Family: Thyroid hormone receptor-related factors (NR1)
JASPAR ID: MA1969.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P10827  
Source: ENCSR264CZJ
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.01 0.04 0.03 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.05 0.06 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

A [ 255 295 426 336 321 312 273 394 422 319 257 323 358 256 385 412 703 75 150 20 54 1062 273 296 39 288 1005 12 7 480 65 1075 200 372 407 325 280 313 244 342 439 251 397 251 291 380 270 283 318 278 ]
C [ 344 286 294 250 303 394 410 256 298 260 266 365 271 368 276 258 19 18 18 144 945 31 399 434 249 200 10 11 9 141 1055 47 427 284 248 261 287 219 321 252 272 288 296 511 437 284 296 417 374 288 ]
G [ 407 466 320 489 455 373 362 391 374 505 517 346 423 452 316 498 566 1193 982 167 90 141 211 242 36 724 296 1285 1275 54 94 117 442 478 443 484 393 427 381 480 388 523 350 273 331 390 453 334 326 287 ]
T [ 312 271 278 243 239 239 273 277 224 234 278 284 266 242 341 150 30 32 168 987 229 84 435 346 994 106 7 10 27 643 104 79 249 184 220 248 358 359 372 244 219 256 275 283 259 264 299 284 300 465 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.02 -0.03 -0.04 -0.01 0.03 -0.00 0.00 -0.02 0.01 0.04 -0.03 -0.03 0.01 -0.01 0.03 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 ]
C [ 0.01 0.01 0.02 0.00 -0.01 -0.00 -0.03 0.00 0.04 -0.03 0.01 0.00 0.02 0.00 -0.00 0.01 -0.02 -0.01 0.04 -0.02 0.01 0.01 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.01 -0.01 0.02 0.02 0.04 0.04 0.00 -0.02 0.02 -0.01 -0.00 -0.03 0.01 0.02 0.05 0.06 -0.03 -0.01 0.01 -0.00 0.01 0.01 0.00 ]
T [ 0.01 -0.01 0.00 -0.01 -0.03 -0.03 0.01 0.04 -0.00 -0.02 0.01 0.01 0.03 -0.02 -0.06 -0.03 -0.01 0.02 -0.00 -0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]

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Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP001185.1 THRA ENCSR551QJT HepG2 Homo sapiens MA1969.2
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