Detailed information of deep learning profile BP000613.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for MYC in MCF-7 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.

Model details

Name: MYC
Model ID: BP000613.1
Cell line/tissue: MCF-7
Class: Basic helix-loop-helix factors (bHLH)
Family: bHLH-ZIP
JASPAR ID: MA0147.4
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P61244  
Source: ENCSR000DMJ
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.03 0.00 0.04 0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.03 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 177 159 193 191 168 186 191 182 159 161 174 150 159 184 157 155 127 214 129 167 109 190 171 186 114 65 543 1 17 69 36 93 149 173 132 191 139 175 126 215 116 136 170 173 185 165 175 166 172 161 ]
C [ 260 281 245 243 281 253 252 233 257 269 285 297 268 260 297 212 388 304 375 171 461 285 202 156 394 715 71 835 3 159 31 277 331 297 376 292 268 252 398 256 269 302 298 279 265 246 261 264 257 262 ]
G [ 263 233 241 249 254 243 255 267 266 262 235 214 277 237 212 337 196 190 164 382 175 225 309 378 244 41 151 3 837 50 722 342 177 221 217 175 285 296 175 175 293 256 214 245 225 245 271 252 230 249 ]
T [ 158 185 179 175 155 176 160 176 176 166 164 197 154 177 192 154 147 150 190 138 113 158 176 138 106 37 93 19 1 580 69 146 201 167 133 200 166 135 159 212 180 164 176 161 183 202 151 176 199 186 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.01 -0.04 -0.02 -0.03 -0.03 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 ]
C [ 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.00 0.05 0.00 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 ]
G [ 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.00 0.05 0.00 0.03 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 ]
T [ -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.03 -0.02 -0.02 -0.02 -0.03 -0.03 -0.02 -0.04 -0.01 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 -0.02 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_6

Num. of seqlets: 329

CWM

PFM

     

HCWM

22 profiles found for the same TF (MYC) in other cell types/tissues

Display profiles


Model ID Name Data Source Cell line/tissue Species JASPAR ID Sequence logo
BP000629.1 MYC ENCSR744JJU K562 Homo sapiens MA0147.4
BP000630.1 MYC ENCSR784BVD HepG2 Homo sapiens MA0147.4
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