This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in gastrocnemius medialis using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
Name: | CTCF |
Model ID: | BP000448.1 |
Cell line/tissue: | gastrocnemius medialis |
Class: | C2H2 zinc finger factors |
Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
JASPAR ID: | MA0139.2 |
Taxon: | Vertebrates |
Species: | Homo sapiens |
Data Type: | ChIP-seq |
Uniprot ID: | P49711 |
Source: | ENCSR998NQG |
Model: | BPNet |
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A [ | 0.01 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.04 | -0.00 | 0.07 | 0.12 | 0.03 | 0.05 | 0.13 | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | ] |
G [ | -0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.02 | -0.00 | 0.07 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.05 | -0.00 | 0.13 | 0.07 | -0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.00 | ] |
T [ | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | 0.06 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |
A [ | 4297 | 4292 | 4360 | 5580 | 5210 | 4896 | 4748 | 4885 | 3824 | 5147 | 4896 | 3765 | 3987 | 3436 | 5717 | 6928 | 2020 | 8094 | 1749 | 980 | 1759 | 1661 | 307 | 7288 | 188 | 97 | 899 | 7377 | 505 | 2191 | 112 | 1089 | 3445 | 4494 | 8200 | 5292 | 6271 | 4994 | 4414 | 4262 | 5314 | 4901 | 6174 | 9275 | 6572 | 3663 | 4549 | 4224 | 5819 | 5734 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 5369 | 5417 | 5769 | 4546 | 4395 | 5052 | 5526 | 5386 | 5499 | 2871 | 2714 | 4540 | 5429 | 8672 | 4344 | 5514 | 5765 | 2226 | 6240 | 9528 | 878 | 16612 | 19008 | 10849 | 11681 | 19491 | 1494 | 1375 | 6343 | 2988 | 102 | 1099 | 8990 | 7346 | 2653 | 5088 | 3933 | 4342 | 4620 | 4372 | 3404 | 2835 | 4492 | 4271 | 4795 | 4822 | 3321 | 7388 | 7251 | 5097 | ] |
G [ | 5204 | 5092 | 4859 | 4594 | 4297 | 4612 | 4725 | 5819 | 3868 | 6863 | 8444 | 7052 | 5661 | 3546 | 3879 | 4085 | 4873 | 6921 | 9936 | 1238 | 14573 | 991 | 274 | 752 | 153 | 77 | 554 | 8185 | 12139 | 766 | 19350 | 15958 | 1880 | 4032 | 6536 | 4931 | 4435 | 5284 | 5800 | 6568 | 7401 | 8796 | 4798 | 3025 | 3652 | 4064 | 6697 | 5038 | 3303 | 4985 | ] |
T [ | 5052 | 5121 | 4934 | 5202 | 6020 | 5362 | 4923 | 3832 | 6731 | 5041 | 3868 | 4565 | 4845 | 4268 | 5982 | 3395 | 7264 | 2681 | 1997 | 8176 | 2712 | 658 | 333 | 1033 | 7900 | 257 | 16975 | 2985 | 935 | 13977 | 358 | 1776 | 5607 | 4050 | 2533 | 4611 | 5283 | 5302 | 5088 | 4720 | 3803 | 3390 | 4458 | 3351 | 4903 | 7373 | 5355 | 3272 | 3549 | 4106 | ] |
A [ | -0.01 | -0.01 | 0.00 | 0.02 | -0.03 | 0.02 | -0.01 | -0.05 | -0.01 | 0.00 | -0.03 | 0.02 | -0.06 | -0.04 | -0.03 | 0.04 | -0.04 | -0.02 | -0.05 | -0.03 | -0.01 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.01 | 0.03 | 0.00 | 0.02 | 0.02 | -0.01 | 0.03 | 0.09 | -0.02 | 0.09 | 0.12 | 0.07 | 0.10 | 0.13 | 0.02 | -0.01 | 0.04 | 0.06 | -0.02 | -0.02 | 0.04 | 0.03 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | ] |
G [ | 0.01 | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.04 | -0.02 | 0.09 | -0.03 | -0.03 | 0.00 | -0.06 | -0.01 | -0.01 | 0.04 | 0.08 | -0.03 | 0.13 | 0.09 | -0.01 | 0.02 | 0.04 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | ] |
T [ | 0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | -0.03 | -0.03 | -0.04 | 0.04 | -0.04 | 0.07 | -0.02 | -0.03 | 0.03 | -0.02 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | -0.02 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |