This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in cardiac muscle cell using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
Name: | CTCF |
Model ID: | BP000351.1 |
Cell line/tissue: | cardiac muscle cell |
Class: | C2H2 zinc finger factors |
Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
JASPAR ID: | MA0139.2 |
Taxon: | Vertebrates |
Species: | Homo sapiens |
Data Type: | ChIP-seq |
Uniprot ID: | P49711 |
Source: | ENCSR713SXF |
Model: | BPNet |
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A [ | 0.01 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.01 | 0.05 | 0.00 | 0.10 | 0.15 | 0.05 | 0.07 | 0.16 | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | ] |
G [ | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.03 | 0.00 | 0.07 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.05 | 0.00 | 0.15 | 0.08 | -0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.00 | ] |
T [ | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.07 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |
A [ | 4577 | 4283 | 4410 | 4902 | 4875 | 4568 | 4526 | 4712 | 4088 | 4733 | 4767 | 3886 | 4117 | 3629 | 5648 | 6595 | 2660 | 7798 | 2506 | 1399 | 1900 | 1681 | 477 | 5543 | 273 | 176 | 1460 | 6976 | 768 | 3427 | 298 | 1413 | 3608 | 4628 | 6693 | 4972 | 5763 | 5013 | 4523 | 4510 | 4893 | 4731 | 5702 | 7851 | 5986 | 4057 | 4450 | 4322 | 5423 | 5568 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 5140 | 5346 | 5287 | 4828 | 4793 | 5288 | 5396 | 5400 | 5136 | 3949 | 3715 | 5277 | 5325 | 7688 | 4499 | 5340 | 5854 | 2508 | 5336 | 9337 | 1292 | 15489 | 18311 | 11487 | 12606 | 18925 | 2127 | 1862 | 7247 | 3263 | 413 | 1802 | 8199 | 6234 | 3226 | 4877 | 4192 | 4580 | 4763 | 4411 | 3749 | 3427 | 4532 | 4573 | 4707 | 4599 | 3915 | 6517 | 6589 | 4949 | ] |
G [ | 4976 | 5042 | 4872 | 4789 | 4765 | 4632 | 4753 | 5177 | 4502 | 5873 | 6856 | 6061 | 5184 | 4044 | 4003 | 4081 | 4704 | 6149 | 9504 | 1962 | 12806 | 1546 | 293 | 823 | 217 | 99 | 603 | 7558 | 9888 | 1440 | 17863 | 14213 | 2503 | 4425 | 6596 | 5436 | 4656 | 5191 | 5514 | 6039 | 6930 | 7803 | 4903 | 3443 | 4036 | 4364 | 6049 | 5083 | 3724 | 4741 | ] |
T [ | 4833 | 4855 | 4957 | 5007 | 5093 | 5038 | 4851 | 4237 | 5800 | 4971 | 4188 | 4302 | 4900 | 4165 | 5376 | 3510 | 6308 | 3071 | 2180 | 6828 | 3528 | 810 | 445 | 1673 | 6430 | 326 | 15336 | 3130 | 1623 | 11396 | 952 | 2098 | 5216 | 4239 | 3011 | 4241 | 4915 | 4742 | 4726 | 4566 | 3954 | 3565 | 4389 | 3659 | 4797 | 6506 | 5112 | 3604 | 3790 | 4268 | ] |
A [ | -0.01 | -0.01 | 0.01 | 0.02 | -0.03 | 0.02 | -0.01 | -0.06 | -0.02 | 0.00 | -0.04 | 0.02 | -0.06 | -0.04 | -0.03 | 0.05 | -0.05 | -0.02 | -0.07 | -0.04 | -0.02 | -0.01 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | -0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.02 | 0.03 | 0.00 | 0.02 | 0.02 | -0.01 | 0.04 | 0.12 | -0.02 | 0.12 | 0.15 | 0.09 | 0.12 | 0.16 | 0.02 | -0.02 | 0.05 | 0.06 | -0.02 | -0.02 | 0.05 | 0.04 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | ] |
G [ | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.04 | 0.06 | -0.02 | 0.11 | -0.03 | -0.04 | -0.00 | -0.07 | -0.02 | -0.01 | 0.04 | 0.09 | -0.02 | 0.16 | 0.10 | -0.01 | 0.03 | 0.05 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | ] |
T [ | 0.00 | -0.01 | 0.01 | -0.02 | 0.02 | -0.02 | -0.02 | 0.02 | -0.02 | -0.05 | -0.05 | -0.06 | 0.04 | -0.05 | 0.08 | -0.02 | -0.02 | 0.03 | -0.03 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | -0.02 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |