This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in spleen using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
Name: | CTCF |
Model ID: | BP000320.1 |
Cell line/tissue: | spleen |
Class: | C2H2 zinc finger factors |
Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
JASPAR ID: | MA0139.2 |
Taxon: | Vertebrates |
Species: | Homo sapiens |
Data Type: | ChIP-seq |
Uniprot ID: | P49711 |
Source: | ENCSR601FEB |
Model: | BPNet |
Download trained model | |
Download TF-MoDISco Report |
A [ | 0.01 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.00 | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.05 | -0.00 | 0.10 | 0.15 | 0.05 | 0.06 | 0.15 | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | ] |
G [ | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.03 | -0.00 | 0.08 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.06 | -0.00 | 0.15 | 0.08 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | ] |
T [ | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | 0.07 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |
A [ | 3983 | 3942 | 4040 | 4821 | 4605 | 4293 | 4285 | 4407 | 3688 | 4458 | 4400 | 3512 | 3720 | 3257 | 5257 | 6232 | 2118 | 7506 | 1913 | 1013 | 1666 | 1510 | 252 | 5856 | 210 | 140 | 1100 | 6701 | 631 | 2550 | 198 | 1259 | 3237 | 4322 | 6580 | 4705 | 5353 | 4575 | 4125 | 4132 | 4670 | 4491 | 5267 | 7322 | 5586 | 3639 | 4151 | 4011 | 4919 | 5100 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 4961 | 4869 | 5049 | 4341 | 4192 | 4755 | 5017 | 4845 | 4809 | 3143 | 3029 | 4595 | 4875 | 7506 | 4084 | 4784 | 5287 | 2055 | 5321 | 8914 | 854 | 15032 | 17237 | 10196 | 11053 | 17515 | 1636 | 1643 | 6250 | 2968 | 248 | 1353 | 7719 | 5843 | 2950 | 4576 | 3847 | 4135 | 4362 | 4147 | 3337 | 3152 | 4249 | 4144 | 4425 | 4385 | 3477 | 5912 | 6184 | 4658 | ] |
G [ | 4576 | 4622 | 4383 | 4206 | 4101 | 4261 | 4272 | 5013 | 3871 | 5749 | 6778 | 5803 | 4845 | 3376 | 3504 | 3733 | 4386 | 5803 | 8950 | 1171 | 12769 | 958 | 197 | 833 | 184 | 99 | 581 | 6760 | 9908 | 1045 | 16982 | 13603 | 2129 | 3936 | 5842 | 4607 | 4206 | 4675 | 5072 | 5399 | 6216 | 7011 | 4368 | 3132 | 3640 | 3785 | 5591 | 4736 | 3388 | 4328 | ] |
T [ | 4482 | 4569 | 4530 | 4634 | 5104 | 4693 | 4428 | 3737 | 5634 | 4652 | 3795 | 4092 | 4562 | 3863 | 5157 | 3253 | 6211 | 2638 | 1818 | 6904 | 2713 | 502 | 316 | 1117 | 6555 | 248 | 14685 | 2898 | 1213 | 11439 | 574 | 1787 | 4917 | 3901 | 2630 | 4114 | 4596 | 4617 | 4443 | 4324 | 3779 | 3348 | 4118 | 3404 | 4351 | 6193 | 4783 | 3343 | 3511 | 3916 | ] |
A [ | -0.01 | -0.01 | 0.01 | 0.02 | -0.03 | 0.03 | -0.01 | -0.06 | -0.02 | 0.00 | -0.04 | 0.02 | -0.06 | -0.04 | -0.04 | 0.05 | -0.06 | -0.03 | -0.07 | -0.03 | -0.02 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.01 | 0.03 | -0.00 | 0.02 | 0.02 | -0.01 | 0.04 | 0.11 | -0.02 | 0.12 | 0.15 | 0.09 | 0.12 | 0.15 | 0.02 | -0.02 | 0.04 | 0.07 | -0.02 | -0.02 | 0.05 | 0.03 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | ] |
G [ | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.03 | 0.06 | -0.02 | 0.11 | -0.03 | -0.04 | -0.01 | -0.06 | -0.01 | -0.01 | 0.04 | 0.10 | -0.02 | 0.16 | 0.11 | -0.01 | 0.04 | 0.04 | 0.01 | 0.01 | ] |
T [ | 0.00 | -0.01 | 0.01 | -0.02 | 0.03 | -0.02 | -0.02 | 0.02 | -0.02 | -0.05 | -0.04 | -0.06 | 0.04 | -0.05 | 0.08 | -0.02 | -0.02 | 0.04 | -0.03 | -0.01 | 0.02 | -0.02 | -0.02 | 0.00 | 0.00 | ] |