This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in heart right ventricle using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
Name: | CTCF |
Model ID: | BP000292.1 |
Cell line/tissue: | heart right ventricle |
Class: | C2H2 zinc finger factors |
Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
JASPAR ID: | MA0139.2 |
Taxon: | Vertebrates |
Species: | Homo sapiens |
Data Type: | ChIP-seq |
Uniprot ID: | P49711 |
Source: | ENCSR505RTK |
Model: | BPNet |
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A [ | 0.01 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.01 | -0.00 | 0.01 | 0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.01 | 0.06 | -0.00 | 0.12 | 0.18 | 0.05 | 0.08 | 0.19 | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | ] |
G [ | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.03 | -0.00 | 0.10 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.07 | -0.00 | 0.20 | 0.10 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | ] |
T [ | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | 0.09 | -0.01 | -0.00 | 0.04 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.01 | -0.00 | -0.00 | ] |
A [ | 3797 | 3976 | 3756 | 3698 | 3832 | 4443 | 4235 | 4016 | 3921 | 4129 | 3486 | 4284 | 4181 | 3339 | 3518 | 3020 | 4921 | 5760 | 1914 | 6974 | 1804 | 1022 | 1584 | 1427 | 218 | 5743 | 199 | 127 | 1123 | 6011 | 608 | 2568 | 106 | 1176 | 3087 | 3978 | 5905 | 4412 | 4942 | 4231 | 3932 | 3858 | 4333 | 4168 | 4782 | 6667 | 5104 | 3456 | 3826 | 3760 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 4452 | 4185 | 4370 | 4367 | 4499 | 3895 | 3751 | 4334 | 4495 | 4386 | 4424 | 2877 | 2709 | 4203 | 4450 | 6791 | 3568 | 4371 | 4865 | 1794 | 4745 | 7833 | 597 | 13973 | 15925 | 8739 | 9908 | 15979 | 1667 | 1452 | 6138 | 2190 | 137 | 1228 | 6890 | 5202 | 2722 | 3995 | 3347 | 3738 | 3919 | 3737 | 3160 | 2835 | 3889 | 3710 | 3958 | 3943 | 3240 | 5282 | ] |
G [ | 4209 | 4037 | 4098 | 4148 | 4032 | 3818 | 3842 | 3764 | 3881 | 4487 | 3474 | 5077 | 6059 | 5241 | 4362 | 3073 | 3210 | 3435 | 3926 | 5291 | 8210 | 1038 | 11652 | 647 | 71 | 744 | 176 | 89 | 503 | 6332 | 8581 | 954 | 15859 | 12345 | 2002 | 3537 | 5282 | 4336 | 3958 | 4359 | 4499 | 4945 | 5554 | 6292 | 4101 | 2888 | 3448 | 3505 | 4936 | 4209 | ] |
T [ | 4028 | 4288 | 4262 | 4273 | 4123 | 4330 | 4658 | 4372 | 4189 | 3484 | 5102 | 4248 | 3537 | 3703 | 4156 | 3602 | 4787 | 2920 | 5781 | 2427 | 1727 | 6593 | 2653 | 439 | 272 | 1260 | 6203 | 291 | 13193 | 2691 | 1159 | 10774 | 384 | 1737 | 4507 | 3769 | 2577 | 3743 | 4239 | 4158 | 4136 | 3946 | 3439 | 3191 | 3714 | 3221 | 3976 | 5582 | 4484 | 3235 | ] |
A [ | -0.01 | -0.01 | 0.01 | 0.03 | -0.04 | 0.04 | -0.02 | -0.07 | -0.02 | 0.01 | -0.04 | 0.03 | -0.07 | -0.04 | -0.04 | 0.07 | -0.06 | -0.03 | -0.10 | -0.04 | -0.02 | -0.01 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.02 | 0.04 | 0.00 | 0.02 | 0.03 | -0.01 | 0.05 | 0.13 | -0.04 | 0.14 | 0.19 | 0.11 | 0.15 | 0.20 | 0.02 | -0.03 | 0.05 | 0.08 | -0.03 | -0.04 | 0.06 | 0.04 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | ] |
G [ | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.04 | 0.07 | -0.02 | 0.14 | -0.04 | -0.04 | -0.00 | -0.09 | -0.03 | -0.02 | 0.06 | 0.13 | -0.04 | 0.21 | 0.13 | -0.03 | 0.04 | 0.06 | 0.02 | 0.01 | ] |
T [ | 0.00 | -0.01 | 0.02 | -0.02 | 0.04 | -0.02 | -0.02 | 0.03 | -0.01 | -0.05 | -0.06 | -0.07 | 0.06 | -0.06 | 0.11 | -0.02 | -0.03 | 0.05 | -0.03 | -0.00 | 0.03 | -0.02 | -0.02 | -0.00 | 0.01 | ] |