This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in CD4-positive and alpha-beta T cell using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
Name: | CTCF |
Model ID: | BP000283.1 |
Cell line/tissue: | CD4-positive and alpha-beta T cell |
Class: | C2H2 zinc finger factors |
Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
JASPAR ID: | MA0139.2 |
Taxon: | Vertebrates |
Species: | Homo sapiens |
Data Type: | ChIP-seq |
Uniprot ID: | P49711 |
Source: | ENCSR470KCE |
Model: | BPNet |
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A [ | 0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.07 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | 0.08 | 0.15 | -0.00 | 0.05 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.08 | -0.00 | 0.03 | 0.01 | 0.00 | -0.00 | ] |
G [ | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | 0.15 | 0.07 | 0.05 | 0.15 | 0.10 | -0.00 | 0.05 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |
T [ | 0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.01 | ] |
A [ | 3607 | 3157 | 2972 | 4304 | 5698 | 4032 | 3049 | 3742 | 2989 | 3333 | 3885 | 4018 | 4170 | 4140 | 3794 | 2385 | 3523 | 4576 | 1643 | 528 | 10379 | 1197 | 2552 | 13456 | 216 | 5818 | 1020 | 282 | 525 | 2400 | 6272 | 1638 | 2345 | 5739 | 2943 | 4737 | 3516 | 4207 | 3739 | 3417 | 4224 | 5112 | 3457 | 4048 | 4322 | 4606 | 4164 | 4205 | 4130 | 4051 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 4066 | 3118 | 4296 | 5259 | 3491 | 3365 | 2799 | 4015 | 6867 | 5882 | 5257 | 4752 | 4438 | 3950 | 4208 | 5488 | 3668 | 1932 | 12410 | 15534 | 1128 | 9007 | 6582 | 577 | 89 | 129 | 715 | 124 | 851 | 11799 | 1064 | 8454 | 5541 | 4075 | 3413 | 3297 | 3073 | 4495 | 5484 | 6403 | 5295 | 3535 | 4700 | 3960 | 3884 | 3877 | 3954 | 4101 | 4243 | 4309 | ] |
G [ | 4235 | 5742 | 5635 | 3207 | 4103 | 4045 | 3795 | 3919 | 2721 | 3063 | 3751 | 4038 | 3870 | 3487 | 4220 | 2680 | 5571 | 7207 | 1338 | 266 | 2658 | 5767 | 1526 | 1499 | 16109 | 10405 | 9466 | 15864 | 13814 | 809 | 8280 | 4706 | 1847 | 4849 | 4539 | 3800 | 7028 | 4485 | 4189 | 2673 | 2852 | 4498 | 4452 | 4556 | 4373 | 3913 | 4021 | 4568 | 4551 | 4495 | ] |
T [ | 4628 | 4519 | 3633 | 3766 | 3244 | 5094 | 6893 | 4860 | 3959 | 4258 | 3643 | 3728 | 4058 | 4959 | 4314 | 5983 | 3774 | 2821 | 1145 | 208 | 2371 | 565 | 5876 | 1004 | 122 | 184 | 5335 | 266 | 1346 | 1528 | 920 | 1738 | 6803 | 1873 | 5641 | 4702 | 2919 | 3349 | 3124 | 4043 | 4165 | 3391 | 3927 | 3972 | 3957 | 4140 | 4397 | 3662 | 3612 | 3681 | ] |
A [ | 0.01 | 0.01 | -0.01 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | -0.03 | 0.03 | -0.02 | -0.01 | 0.08 | -0.05 | 0.05 | -0.06 | -0.04 | -0.05 | -0.02 | 0.02 | -0.02 | -0.02 | 0.03 | -0.02 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.01 | 0.01 | 0.04 | 0.04 | -0.01 | 0.10 | 0.16 | -0.02 | 0.10 | 0.05 | -0.00 | -0.01 | -0.07 | -0.00 | -0.05 | -0.03 | 0.11 | -0.02 | 0.06 | 0.04 | 0.02 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | 0.01 | ] |
G [ | 0.01 | 0.01 | -0.00 | 0.03 | 0.05 | -0.02 | -0.02 | 0.07 | 0.04 | -0.02 | 0.01 | 0.16 | 0.12 | 0.09 | 0.16 | 0.12 | -0.02 | 0.11 | 0.03 | -0.01 | 0.02 | 0.02 | -0.00 | 0.03 | 0.01 | ] |
T [ | 0.01 | 0.01 | 0.02 | -0.00 | -0.01 | -0.02 | -0.06 | -0.02 | -0.05 | 0.05 | -0.03 | -0.04 | -0.07 | 0.03 | -0.04 | 0.01 | -0.02 | -0.05 | -0.01 | 0.03 | -0.03 | 0.02 | 0.01 | -0.01 | -0.01 | ] |