This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in upper lobe of left lung using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
Name: | CTCF |
Model ID: | BP000278.1 |
Cell line/tissue: | upper lobe of left lung |
Class: | C2H2 zinc finger factors |
Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
JASPAR ID: | MA0139.2 |
Taxon: | Vertebrates |
Species: | Homo sapiens |
Data Type: | ChIP-seq |
Uniprot ID: | P49711 |
Source: | ENCSR463XCZ |
Model: | BPNet |
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A [ | -0.00 | -0.00 | -0.01 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.07 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | 0.09 | 0.16 | -0.00 | 0.06 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.08 | -0.00 | 0.03 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | ] |
G [ | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | 0.16 | 0.06 | 0.05 | 0.15 | 0.10 | -0.00 | 0.05 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |
T [ | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.01 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.01 | ] |
A [ | 4409 | 3853 | 3681 | 5383 | 7002 | 4841 | 3651 | 4437 | 3605 | 4000 | 4689 | 4801 | 5036 | 5045 | 4375 | 2808 | 4279 | 5448 | 1876 | 572 | 12700 | 1275 | 3164 | 15974 | 260 | 7214 | 1383 | 461 | 752 | 3254 | 7642 | 2194 | 2902 | 6793 | 3600 | 5739 | 4334 | 4921 | 4527 | 4191 | 5152 | 6155 | 4219 | 4949 | 5204 | 5534 | 5075 | 4999 | 4989 | 5008 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 4592 | 3420 | 4976 | 6109 | 4000 | 3754 | 3210 | 4750 | 7979 | 6854 | 6027 | 5486 | 5060 | 4564 | 5135 | 6458 | 4221 | 2144 | 15149 | 18584 | 933 | 11014 | 7292 | 552 | 117 | 235 | 957 | 363 | 1367 | 13177 | 1558 | 9354 | 6212 | 4771 | 4041 | 3696 | 3605 | 5259 | 6258 | 7170 | 6008 | 4078 | 5288 | 4621 | 4476 | 4462 | 4492 | 4653 | 4899 | 4830 | ] |
G [ | 4835 | 6702 | 6497 | 3498 | 4563 | 4642 | 4159 | 4351 | 3040 | 3441 | 4295 | 4587 | 4352 | 3924 | 4760 | 3001 | 6380 | 8356 | 1237 | 214 | 3066 | 6659 | 1519 | 1886 | 18994 | 11844 | 10843 | 18295 | 15711 | 1145 | 9091 | 5716 | 2398 | 5574 | 5108 | 4362 | 7955 | 5208 | 4834 | 3176 | 3425 | 5218 | 5147 | 5265 | 5011 | 4424 | 4645 | 5306 | 5230 | 5164 | ] |
T [ | 5705 | 5566 | 4387 | 4551 | 3976 | 6304 | 8521 | 6003 | 4917 | 5246 | 4530 | 4667 | 5093 | 6008 | 5271 | 7274 | 4661 | 3593 | 1279 | 171 | 2842 | 593 | 7566 | 1129 | 170 | 248 | 6358 | 422 | 1711 | 1965 | 1250 | 2277 | 8029 | 2403 | 6792 | 5744 | 3647 | 4153 | 3922 | 5004 | 4956 | 4090 | 4887 | 4706 | 4850 | 5121 | 5329 | 4583 | 4423 | 4539 | ] |
A [ | -0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.02 | -0.02 | 0.02 | -0.01 | -0.04 | 0.04 | -0.02 | -0.02 | 0.08 | -0.05 | 0.04 | -0.06 | -0.05 | -0.05 | -0.01 | 0.02 | -0.02 | -0.02 | 0.02 | -0.02 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.05 | 0.04 | -0.01 | 0.11 | 0.17 | -0.03 | 0.11 | 0.05 | -0.01 | -0.02 | -0.06 | 0.00 | -0.03 | -0.02 | 0.11 | -0.01 | 0.05 | 0.04 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | ] |
G [ | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | 0.03 | 0.05 | -0.02 | -0.02 | 0.07 | 0.04 | -0.02 | 0.02 | 0.16 | 0.12 | 0.09 | 0.15 | 0.11 | -0.02 | 0.11 | 0.04 | -0.01 | 0.02 | 0.02 | -0.00 | 0.03 | 0.01 | ] |
T [ | -0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | -0.01 | -0.02 | -0.04 | -0.07 | -0.03 | -0.06 | 0.05 | -0.04 | -0.04 | -0.07 | 0.02 | -0.04 | 0.00 | -0.02 | -0.05 | -0.01 | 0.02 | -0.03 | 0.02 | 0.01 | -0.01 | -0.01 | ] |