This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in HCT116 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
| Name: | CTCF |
| Model ID: | BP000271.1 |
| Cell line/tissue: | HCT116 |
| Class: | C2H2 zinc finger factors |
| Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
| JASPAR ID: | MA0139.2 |
| Taxon: | Vertebrates |
| Species: | Homo sapiens |
| Data Type: | ChIP-seq |
| Uniprot ID: | P49711 |
| Source: | ENCSR450DXU |
| Model: | BPNet |
| Download trained model | |
| Download TF-MoDISco Report |
| A [ | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.07 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.00 | 0.01 | 0.00 | -0.00 | 0.09 | 0.15 | 0.00 | 0.05 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.06 | 0.00 | 0.02 | 0.01 | 0.00 | -0.00 | ] |
| G [ | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | 0.15 | 0.07 | 0.05 | 0.13 | 0.08 | 0.00 | 0.04 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |
| T [ | 0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.01 | ] |
| A [ | 4060 | 3561 | 3295 | 4855 | 6634 | 4634 | 3176 | 4334 | 3172 | 3834 | 4408 | 4569 | 4507 | 4471 | 3976 | 2612 | 3801 | 5374 | 1753 | 744 | 11309 | 1463 | 2738 | 14197 | 306 | 5386 | 1801 | 636 | 1385 | 3510 | 6133 | 2584 | 3241 | 5819 | 3621 | 5062 | 4047 | 4778 | 4317 | 4264 | 4787 | 5266 | 4135 | 4575 | 4720 | 4815 | 4623 | 4610 | 4679 | 4551 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 4049 | 2913 | 4291 | 5498 | 3570 | 3345 | 2817 | 4088 | 7534 | 6256 | 5391 | 4836 | 4460 | 4101 | 4840 | 5824 | 4015 | 1884 | 13564 | 16336 | 1177 | 9456 | 6622 | 426 | 126 | 188 | 796 | 539 | 1648 | 10400 | 2163 | 7823 | 5131 | 3937 | 3602 | 3353 | 3422 | 4455 | 4980 | 5525 | 4809 | 3902 | 4448 | 4033 | 4039 | 4116 | 4112 | 4121 | 4186 | 4301 | ] |
| G [ | 4163 | 5865 | 6106 | 3002 | 3854 | 4074 | 3558 | 3757 | 2673 | 2898 | 3705 | 3983 | 3696 | 3515 | 4027 | 2593 | 5518 | 7092 | 1184 | 276 | 1993 | 6035 | 1243 | 1771 | 16965 | 11588 | 10064 | 15543 | 12734 | 1486 | 7567 | 4603 | 2399 | 4961 | 4489 | 3993 | 6443 | 4460 | 4509 | 3235 | 3502 | 4342 | 4557 | 4554 | 4445 | 3958 | 4137 | 4601 | 4536 | 4413 | ] |
| T [ | 5326 | 5259 | 3906 | 4243 | 3540 | 5545 | 8047 | 5419 | 4219 | 4610 | 4094 | 4210 | 4935 | 5511 | 4755 | 6569 | 4264 | 3248 | 1097 | 242 | 3119 | 644 | 6995 | 1204 | 201 | 436 | 4937 | 880 | 1831 | 2202 | 1735 | 2588 | 6827 | 2881 | 5886 | 5190 | 3686 | 3905 | 3792 | 4574 | 4500 | 4088 | 4458 | 4436 | 4394 | 4709 | 4726 | 4266 | 4197 | 4333 | ] |
| A [ | 0.00 | 0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.03 | -0.02 | 0.02 | -0.01 | -0.03 | 0.03 | -0.02 | -0.02 | 0.08 | -0.05 | 0.03 | -0.04 | -0.04 | -0.04 | -0.01 | 0.01 | -0.01 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | 0.01 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.01 | 0.01 | 0.00 | 0.02 | 0.04 | 0.03 | -0.02 | 0.11 | 0.16 | -0.02 | 0.09 | 0.04 | -0.02 | -0.02 | -0.07 | -0.01 | -0.04 | -0.03 | 0.09 | -0.02 | 0.04 | 0.02 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | ] |
| G [ | 0.00 | 0.01 | 0.00 | 0.01 | -0.01 | 0.03 | 0.04 | -0.03 | -0.03 | 0.05 | 0.04 | -0.03 | 0.01 | 0.15 | 0.11 | 0.08 | 0.14 | 0.09 | -0.02 | 0.08 | 0.02 | -0.01 | 0.02 | 0.01 | -0.00 | ] |
| T [ | -0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | -0.00 | -0.02 | -0.04 | -0.07 | -0.02 | -0.06 | 0.05 | -0.03 | -0.04 | -0.05 | 0.01 | -0.04 | -0.00 | -0.02 | -0.05 | -0.01 | 0.02 | -0.02 | 0.02 | 0.01 | ] |