This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in PC-3 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
Name: | CTCF |
Model ID: | BP000236.1 |
Cell line/tissue: | PC-3 |
Class: | C2H2 zinc finger factors |
Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
JASPAR ID: | MA0139.2 |
Taxon: | Vertebrates |
Species: | Homo sapiens |
Data Type: | ChIP-seq |
Uniprot ID: | P49711 |
Source: | ENCSR359LOD |
Model: | BPNet |
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A [ | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.06 | -0.00 | 0.01 | -0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.00 | 0.01 | 0.00 | -0.00 | 0.08 | 0.14 | 0.00 | 0.04 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.07 | 0.00 | 0.03 | 0.01 | 0.00 | 0.00 | ] |
G [ | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | 0.15 | 0.07 | 0.05 | 0.14 | 0.10 | 0.00 | 0.05 | 0.01 | -0.00 | 0.01 | 0.00 | ] |
T [ | 0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.01 | ] |
A [ | 4690 | 4327 | 4082 | 5247 | 6395 | 5114 | 4010 | 4697 | 3993 | 4324 | 4892 | 5071 | 4787 | 5098 | 4688 | 3432 | 4691 | 5683 | 2467 | 1240 | 11356 | 2089 | 3425 | 15186 | 434 | 6009 | 2302 | 516 | 1081 | 3910 | 7119 | 2446 | 3524 | 6598 | 3847 | 5517 | 4391 | 5306 | 4614 | 4681 | 5095 | 5764 | 4665 | 5019 | 5268 | 5227 | 5163 | 5197 | 5149 | 5194 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 4833 | 3988 | 5105 | 5963 | 4564 | 4315 | 3915 | 5052 | 7654 | 6753 | 5985 | 5512 | 5401 | 4889 | 5616 | 6614 | 4616 | 2775 | 14290 | 17837 | 1803 | 9667 | 7296 | 614 | 122 | 160 | 709 | 303 | 1638 | 12852 | 2105 | 9492 | 6225 | 4683 | 4179 | 4144 | 4218 | 5163 | 5820 | 6553 | 5706 | 4671 | 5225 | 4917 | 4762 | 4865 | 4931 | 4880 | 5059 | 5056 | ] |
G [ | 5055 | 6294 | 6401 | 4036 | 4724 | 4742 | 4607 | 4657 | 3641 | 3877 | 4457 | 4730 | 4745 | 4305 | 4926 | 3436 | 6084 | 7893 | 1842 | 605 | 2850 | 7433 | 2209 | 2554 | 19333 | 13595 | 11295 | 18793 | 15706 | 1279 | 9247 | 5312 | 2552 | 5877 | 5253 | 4599 | 7514 | 5359 | 5511 | 4055 | 4243 | 5141 | 5409 | 5322 | 5279 | 5058 | 5028 | 5323 | 5345 | 5128 | ] |
T [ | 5619 | 5588 | 4609 | 4951 | 4514 | 6026 | 7665 | 5791 | 4909 | 5243 | 4863 | 4884 | 5264 | 5905 | 4967 | 6715 | 4806 | 3846 | 1598 | 515 | 4188 | 1008 | 7267 | 1843 | 308 | 433 | 5891 | 585 | 1772 | 2156 | 1726 | 2947 | 7896 | 3039 | 6918 | 5937 | 4074 | 4369 | 4252 | 4908 | 5153 | 4621 | 4898 | 4939 | 4888 | 5047 | 5075 | 4797 | 4644 | 4819 | ] |
A [ | 0.00 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | -0.02 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | -0.03 | 0.04 | -0.01 | -0.01 | 0.08 | -0.04 | 0.04 | -0.05 | -0.04 | -0.04 | -0.01 | 0.02 | -0.02 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | ] |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C [ | 0.02 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | 0.04 | 0.03 | -0.01 | 0.10 | 0.16 | -0.01 | 0.10 | 0.04 | -0.01 | -0.03 | -0.06 | -0.01 | -0.04 | -0.02 | 0.11 | -0.01 | 0.06 | 0.04 | 0.03 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | ] |
G [ | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | -0.00 | 0.03 | 0.04 | -0.02 | -0.03 | 0.05 | 0.04 | -0.01 | 0.03 | 0.16 | 0.12 | 0.10 | 0.15 | 0.12 | -0.01 | 0.11 | 0.04 | -0.01 | 0.03 | 0.02 | 0.00 | 0.03 | 0.01 | ] |
T [ | 0.00 | 0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.02 | -0.00 | -0.01 | -0.03 | -0.06 | -0.01 | -0.04 | 0.05 | -0.02 | -0.02 | -0.05 | 0.02 | -0.03 | 0.00 | -0.02 | -0.04 | -0.01 | 0.03 | -0.03 | 0.03 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | ] |