This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for CTCF in GM12872 using a single trained BPNet model. Please scroll down the page to browse other models for this transcription factor.
Model details
| Name: | CTCF |
| Model ID: | BP000070.1 |
| Cell line/tissue: | GM12872 |
| Class: | C2H2 zinc finger factors |
| Family: | More than 3 adjacent zinc fingers |
| JASPAR ID: | MA0139.2 |
| Taxon: | Vertebrates |
| Species: | Homo sapiens |
| Data Type: | ChIP-seq |
| Uniprot ID: | P49711 |
| Source: | ENCSR000DRN |
| Model: | BPNet |
| Download trained model | |
| Download TF-MoDISco Report |
| A [ | -0.00 | 0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.01 | -0.00 | -0.00 | -0.01 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.04 | 0.00 | 0.09 | 0.15 | 0.06 | 0.08 | 0.16 | 0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | 0.01 | -0.00 | 0.00 | ] |
| G [ | 0.00 | 0.01 | 0.03 | 0.00 | 0.07 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | 0.06 | 0.00 | 0.17 | 0.09 | -0.00 | 0.01 | 0.01 | 0.00 | ] |
| T [ | 0.01 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.00 | 0.07 | -0.00 | -0.00 | 0.02 | -0.00 | -0.00 | 0.00 | -0.00 | -0.00 | -0.00 | ] |
| A [ | 5137 | 4900 | 4940 | 5473 | 5358 | 5087 | 5177 | 5281 | 4772 | 5324 | 5292 | 4480 | 4634 | 4162 | 6046 | 6922 | 3381 | 8073 | 3246 | 2026 | 2630 | 2212 | 792 | 6096 | 533 | 321 | 1812 | 8095 | 869 | 4193 | 335 | 1378 | 3996 | 4938 | 7459 | 5424 | 6241 | 5401 | 5085 | 5107 | 5420 | 4995 | 6255 | 8530 | 6563 | 4447 | 5003 | 4780 | 6095 | 6070 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 5751 | 5755 | 5822 | 5440 | 5412 | 5729 | 5800 | 5781 | 5711 | 4623 | 4320 | 5819 | 5774 | 8124 | 5133 | 5780 | 6304 | 3126 | 5619 | 9611 | 1935 | 15506 | 19580 | 12327 | 14477 | 20638 | 2991 | 2150 | 7513 | 3142 | 444 | 1774 | 8933 | 6852 | 3527 | 5402 | 4724 | 5067 | 5252 | 4781 | 3976 | 3719 | 5011 | 4928 | 5261 | 5148 | 4182 | 7290 | 7169 | 5491 | ] |
| G [ | 5435 | 5556 | 5423 | 5236 | 5342 | 5138 | 5419 | 5702 | 5075 | 6333 | 7204 | 6368 | 5698 | 4607 | 4689 | 4715 | 5267 | 6554 | 9982 | 2891 | 13005 | 2472 | 562 | 1086 | 319 | 203 | 743 | 7743 | 11434 | 1652 | 19915 | 16305 | 2808 | 5105 | 7182 | 5936 | 5232 | 5873 | 6017 | 6524 | 7772 | 8936 | 5322 | 4023 | 4450 | 4756 | 6813 | 5529 | 4013 | 5207 | ] |
| T [ | 5273 | 5385 | 5411 | 5447 | 5484 | 5642 | 5200 | 4832 | 6038 | 5316 | 4780 | 4929 | 5490 | 4703 | 5728 | 4179 | 6644 | 3843 | 2749 | 7068 | 4026 | 1406 | 662 | 2087 | 6267 | 434 | 16050 | 3608 | 1780 | 12609 | 902 | 2139 | 5859 | 4701 | 3428 | 4834 | 5399 | 5255 | 5242 | 5184 | 4428 | 3946 | 5008 | 4115 | 5322 | 7245 | 5598 | 3997 | 4319 | 4828 | ] |
| A [ | -0.00 | -0.01 | 0.01 | 0.02 | -0.03 | 0.03 | -0.01 | -0.04 | -0.02 | 0.00 | -0.03 | 0.02 | -0.06 | -0.03 | -0.01 | 0.06 | -0.05 | -0.02 | -0.08 | -0.04 | -0.02 | -0.01 | 0.02 | 0.00 | 0.01 | 0.00 | ] |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C [ | 0.01 | 0.03 | 0.01 | 0.02 | 0.02 | -0.00 | 0.03 | 0.10 | -0.01 | 0.11 | 0.15 | 0.10 | 0.12 | 0.17 | 0.03 | -0.01 | 0.05 | 0.06 | -0.02 | -0.02 | 0.05 | 0.04 | 0.00 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | ] |
| G [ | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.01 | 0.03 | 0.04 | 0.06 | -0.00 | 0.10 | -0.02 | -0.03 | -0.00 | -0.05 | -0.02 | -0.01 | 0.05 | 0.11 | -0.00 | 0.18 | 0.12 | -0.01 | 0.04 | 0.05 | 0.02 | 0.01 | 0.01 | ] |
| T [ | 0.00 | -0.00 | 0.01 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | -0.01 | 0.01 | -0.01 | -0.04 | -0.05 | -0.05 | 0.03 | -0.05 | 0.08 | -0.01 | -0.02 | 0.04 | -0.03 | -0.01 | 0.02 | -0.01 | -0.02 | 0.00 | 0.00 | 0.00 | ] |