Detailed information of deep learning profile BP001389.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF157 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF157
Model ID: BP001389.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA2331.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P51786  
Source: ENCSR564YYW
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.01 0.05 0.00 -0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.11 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.05 0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 0.03 -0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 0.00 0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 0.07 0.07 0.02 -0.00 0.00 0.06 0.08 -0.00 -0.00 -0.02 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
G [ 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.06 0.00 0.04 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.03 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.12 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.04 -0.00 -0.02 -0.00 -0.00 -0.01 0.03 ]
T [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.04 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.07 -0.00 0.10 -0.00 0.04 0.09 -0.00 0.00 0.04 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.03 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 168 168 163 501 197 226 514 173 452 87 48 371 502 749 245 29 18 540 15 899 15 32 129 120 235 162 201 35 86 86 130 186 104 111 658 163 98 220 260 603 677 291 116 181 586 543 533 152 149 189 ]
C [ 151 134 198 162 157 97 149 501 207 96 77 43 179 53 129 35 68 14 110 8 375 19 32 611 32 69 129 741 755 309 128 190 674 719 116 58 348 117 263 190 112 111 110 591 147 162 143 259 138 156 ]
G [ 487 536 158 184 456 503 167 180 109 729 140 471 108 126 432 899 47 407 28 67 21 52 818 67 90 525 475 135 72 33 88 474 25 40 127 504 442 67 425 65 127 419 659 76 125 137 158 141 163 478 ]
T [ 180 148 467 139 176 160 156 132 218 74 721 101 197 58 180 23 853 25 833 12 575 883 7 188 629 230 181 75 73 558 640 136 183 116 85 261 98 582 38 128 70 165 101 138 128 144 152 434 536 163 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 0.00 -0.01 -0.01 -0.03 0.01 -0.01 0.05 0.01 -0.04 -0.07 0.08 -0.05 0.12 -0.06 -0.04 0.08 0.01 0.06 0.04 0.04 -0.05 0.00 -0.01 0.02 0.04 0.01 0.01 0.06 0.02 -0.01 0.03 0.03 0.01 0.04 0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.02 0.04 -0.01 -0.01 -0.05 0.04 -0.01 0.07 -0.00 0.05 -0.06 0.07 -0.02 0.11 -0.03 -0.02 0.04 -0.03 -0.00 0.02 0.10 0.09 0.08 0.01 0.03 0.08 0.11 0.00 -0.01 -0.03 0.02 0.07 0.04 0.02 0.02 -0.00 ]
G [ 0.02 0.02 -0.00 0.07 0.03 0.08 0.00 0.00 0.01 0.13 0.01 0.11 -0.06 0.03 -0.03 0.04 0.13 0.01 -0.00 0.00 0.01 0.06 0.05 -0.01 0.02 0.01 -0.08 -0.05 0.04 0.03 0.12 -0.04 -0.03 -0.02 -0.00 -0.01 0.04 ]
T [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.05 -0.00 0.02 0.00 -0.02 -0.01 0.08 -0.05 0.11 -0.05 0.07 0.09 -0.10 0.03 0.06 0.05 0.02 -0.01 -0.04 0.02 0.04 -0.01 0.05 -0.01 -0.04 0.01 -0.03 0.03 -0.04 0.00 -0.04 0.01 -0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 877

CWM

PFM

     

HCWM