Detailed information of deep learning profile BP001389.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF157 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF157
Model ID: BP001389.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA2331.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P51786  
Source: ENCSR564YYW
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.03 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.04 0.00 -0.00 0.09 0.04 -0.00 0.10 -0.00 0.07 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.04 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.03 -0.01 -0.00 -0.00 -0.02 -0.00 0.04 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.12 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.03 0.00 0.12 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.06 -0.00 0.00 0.00 0.01 ]
G [ -0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.02 -0.00 -0.00 0.08 0.06 0.00 -0.00 0.02 0.07 0.07 0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 0.03 0.00 0.01 0.01 -0.00 0.00 0.05 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.11 -0.00 0.04 -0.00 -0.00 0.00 0.05 -0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 -0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 163 536 434 152 144 128 138 101 165 70 128 38 582 98 261 85 116 183 136 640 558 73 75 181 230 629 188 7 883 575 12 833 25 853 23 180 58 197 101 721 74 218 132 156 160 176 139 467 148 180 ]
C [ 478 163 141 158 137 125 76 659 419 127 65 425 67 442 504 127 40 25 474 88 33 72 135 475 525 90 67 818 52 21 67 28 407 47 899 432 126 108 471 140 729 109 180 167 503 456 184 158 536 487 ]
G [ 156 138 259 143 162 147 591 110 111 112 190 263 117 348 58 116 719 674 190 128 309 755 741 129 69 32 611 32 19 375 8 110 14 68 35 129 53 179 43 77 96 207 501 149 97 157 162 198 134 151 ]
T [ 189 149 152 533 543 586 181 116 291 677 603 260 220 98 163 658 111 104 186 130 86 86 35 201 162 235 120 129 32 15 899 15 540 18 29 245 749 502 371 48 87 452 173 514 226 197 501 163 168 168 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.01 0.01 -0.04 0.00 -0.04 0.03 -0.03 0.01 -0.04 -0.01 0.05 -0.01 0.04 0.02 -0.04 -0.01 0.02 0.05 0.06 0.03 -0.10 0.09 0.07 -0.05 0.11 -0.05 0.08 -0.01 -0.02 0.00 0.02 -0.00 0.05 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.04 -0.01 -0.00 -0.02 -0.03 -0.04 0.12 0.03 0.04 -0.05 -0.08 0.01 0.02 -0.01 0.05 0.06 0.01 0.00 -0.00 0.01 0.13 0.04 -0.03 0.03 -0.06 0.11 0.01 0.13 0.01 0.00 0.00 0.08 0.03 0.07 -0.00 0.02 0.02 ]
G [ -0.00 0.02 0.02 0.04 0.07 0.02 -0.03 -0.01 0.00 0.11 0.08 0.03 0.01 0.08 0.09 0.10 0.02 -0.00 -0.03 0.04 -0.02 -0.03 0.11 -0.02 0.07 -0.06 0.05 -0.00 0.07 -0.01 0.04 -0.05 -0.01 -0.01 0.04 0.02 0.01 ]
T [ -0.00 0.00 0.04 0.01 0.03 0.03 -0.01 0.02 0.06 0.01 0.01 0.04 0.02 -0.01 0.00 -0.05 0.04 0.04 0.06 0.01 0.08 -0.04 -0.06 0.12 -0.05 0.08 -0.07 -0.04 0.01 0.05 -0.01 0.01 -0.03 -0.01 -0.01 0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 877

CWM

PFM

     

HCWM