Detailed information of deep learning profile BP001388.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF791 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF791
Model ID: BP001388.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0817.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q3KP31  
Source: ENCSR775HFF
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.01 0.00 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.00 0.00 0.02 -0.00 0.02 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.04 -0.00 0.06 -0.00 0.03 0.02 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.01 ]
C [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.04 -0.00 0.00 -0.00 0.05 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.02 -0.00 0.00 ]
G [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.02 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.03 0.04 0.05 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.01 -0.00 0.03 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 155 409 150 128 400 414 163 419 152 459 426 509 503 197 180 233 391 34 296 156 314 15 51 515 13 504 19 585 10 538 446 109 63 38 509 340 69 98 98 88 203 447 71 387 451 92 397 77 66 392 ]
C [ 301 56 64 323 58 57 46 34 52 35 28 18 16 30 136 22 18 474 22 161 19 21 384 22 463 14 38 1 444 8 15 5 6 7 20 40 282 295 246 343 229 18 42 44 22 41 53 317 33 41 ]
G [ 70 74 311 69 79 84 348 100 341 69 107 48 42 335 42 315 65 31 9 24 221 30 13 24 12 50 14 3 11 20 99 408 508 525 36 112 32 24 21 21 66 56 23 45 73 429 73 21 30 77 ]
T [ 65 52 66 71 54 36 34 38 46 28 30 16 30 29 233 21 117 52 264 250 37 525 143 30 103 23 520 2 126 25 31 69 14 21 26 99 208 174 226 139 93 70 455 115 45 29 68 176 462 81 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.03 -0.01 0.04 -0.00 0.03 0.00 0.00 0.04 -0.02 0.05 -0.01 0.06 -0.00 0.04 0.02 0.01 0.03 -0.00 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 -0.00 0.02 0.01 0.02 0.02 0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 0.05 -0.03 0.01 -0.02 -0.01 0.02 -0.03 0.06 -0.03 0.02 -0.04 0.07 -0.01 -0.01 -0.02 -0.02 -0.02 -0.01 -0.01 0.02 0.01 0.03 0.02 0.02 -0.01 0.00 -0.01 -0.01 -0.00 ]
G [ -0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 0.00 0.02 -0.01 0.04 -0.00 0.02 -0.01 -0.01 0.01 0.01 -0.01 0.02 -0.01 0.01 -0.02 -0.00 -0.01 0.00 0.03 0.04 0.04 0.05 0.00 0.00 -0.02 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.03 ]
T [ 0.00 -0.01 -0.01 0.00 -0.01 0.00 -0.02 0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.04 -0.00 0.04 0.02 -0.01 0.04 -0.03 0.04 -0.04 0.01 -0.02 -0.02 -0.00 -0.03 0.01 0.00 0.02 0.01 0.02 0.00 0.02 0.01 -0.01 0.01 -0.00 0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_5

Num. of seqlets: 124

CWM

PFM

     

HCWM