Detailed information of deep learning profile BP001388.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF791 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF791
Model ID: BP001388.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0817.1
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q3KP31  
Source: ENCSR775HFF
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 0.01 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.05 0.04 0.03 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 0.02 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.05 -0.00 0.00 -0.00 0.04 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.04 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ 0.01 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.02 0.03 -0.00 0.06 -0.00 0.04 -0.00 0.03 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.02 -0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.00 0.01 ]

Frequency matrix

       
A [ 81 462 176 68 29 45 115 455 70 93 139 226 174 208 99 26 21 14 69 31 25 126 2 520 23 103 30 143 525 37 250 264 52 117 21 233 29 30 16 30 28 46 38 34 36 54 71 66 52 65 ]
C [ 77 30 21 73 429 73 45 23 56 66 21 21 24 32 112 36 525 508 408 99 20 11 3 14 50 12 24 13 30 221 24 9 31 65 315 42 335 42 48 107 69 341 100 348 84 79 69 311 74 70 ]
G [ 41 33 317 53 41 22 44 42 18 229 343 246 295 282 40 20 7 6 5 15 8 444 1 38 14 463 22 384 21 19 161 22 474 18 22 136 30 16 18 28 35 52 34 46 57 58 323 64 56 301 ]
T [ 392 66 77 397 92 451 387 71 447 203 88 98 98 69 340 509 38 63 109 446 538 10 585 19 504 13 515 51 15 314 156 296 34 391 233 180 197 503 509 426 459 152 419 163 414 400 128 150 409 155 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.01 0.01 0.02 0.00 0.02 0.01 0.02 0.00 0.01 -0.03 -0.00 -0.02 -0.02 0.01 -0.04 0.04 -0.03 0.04 -0.01 0.02 0.04 -0.00 0.04 -0.01 -0.00 -0.00 -0.01 0.01 -0.02 0.00 -0.01 0.00 -0.01 -0.01 0.00 ]
C [ 0.03 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.02 0.00 0.00 0.05 0.04 0.04 0.03 0.00 -0.01 -0.00 -0.02 0.01 -0.01 0.02 -0.01 0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.02 -0.00 0.04 -0.01 0.02 0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 -0.00 ]
G [ -0.00 -0.01 -0.01 0.00 -0.01 0.02 0.02 0.03 0.01 0.02 -0.01 -0.01 -0.02 -0.02 -0.02 -0.01 -0.01 0.07 -0.04 0.02 -0.03 0.06 -0.03 0.02 -0.01 -0.02 0.01 -0.03 0.05 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.02 0.02 0.01 0.02 -0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 -0.00 0.03 0.01 0.02 0.04 -0.00 0.06 -0.01 0.05 -0.02 0.04 0.00 0.00 0.03 -0.00 0.04 -0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_5

Num. of seqlets: 124

CWM

PFM

     

HCWM