Detailed information of deep learning profile BP001385.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for MEIS1 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: MEIS1
Model ID: BP001385.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: Homeo domain factors
Family: TALE-type homeo domain factors
JASPAR ID: MA1639.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: O00470  
Source: ENCSR186JMM
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.04 -0.00 -0.00 0.00 0.05 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.03 0.03 0.01 -0.00 0.03 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 483 479 533 486 498 486 503 472 470 492 468 475 521 493 468 528 534 615 507 552 864 279 152 1835 47 108 312 1839 22 359 599 242 351 344 340 428 504 601 540 515 485 477 477 507 513 516 497 509 497 510 ]
C [ 405 442 404 422 439 421 434 441 423 436 399 439 430 431 400 447 471 345 388 325 210 28 32 6 155 6 208 4 314 105 134 775 577 495 409 401 414 386 338 394 427 411 419 405 412 447 443 424 430 425 ]
G [ 414 431 405 468 421 449 404 453 426 417 452 440 391 396 492 345 425 509 577 533 492 33 1621 3 106 120 404 3 15 934 809 440 304 386 431 474 470 382 459 405 427 435 446 449 435 418 411 415 425 446 ]
T [ 546 496 506 472 490 492 507 482 529 503 529 494 506 528 488 528 418 379 376 438 282 1508 43 4 1540 1614 924 2 1497 450 306 391 616 623 668 545 460 479 511 534 509 525 506 487 488 467 497 500 496 467 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.04 -0.02 -0.01 -0.00 0.05 -0.03 -0.01 0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.01 0.00 -0.01 -0.00 -0.02 -0.02 -0.00 -0.03 -0.02 -0.03 0.02 -0.01 -0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.01 0.01 0.01 -0.03 0.03 -0.02 -0.01 -0.01 0.00 -0.02 -0.03 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.03 -0.01 -0.02 0.03 0.03 0.01 -0.02 0.03 -0.00 -0.01 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 234

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 121

CWM

PFM

     

HCWM