Detailed information of deep learning profile BP001385.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for MEIS1 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: MEIS1
Model ID: BP001385.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: Homeo domain factors
Family: TALE-type homeo domain factors
JASPAR ID: MA1639.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: O00470  
Source: ENCSR186JMM
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 0.01 0.03 0.03 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.01 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.05 0.00 -0.00 -0.00 0.04 0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 467 496 500 497 467 488 487 506 525 509 534 511 479 460 545 668 623 616 391 306 450 1497 2 924 1614 1540 4 43 1508 282 438 376 379 418 528 488 528 506 494 529 503 529 482 507 492 490 472 506 496 546 ]
C [ 446 425 415 411 418 435 449 446 435 427 405 459 382 470 474 431 386 304 440 809 934 15 3 404 120 106 3 1621 33 492 533 577 509 425 345 492 396 391 440 452 417 426 453 404 449 421 468 405 431 414 ]
G [ 425 430 424 443 447 412 405 419 411 427 394 338 386 414 401 409 495 577 775 134 105 314 4 208 6 155 6 32 28 210 325 388 345 471 447 400 431 430 439 399 436 423 441 434 421 439 422 404 442 405 ]
T [ 510 497 509 497 516 513 507 477 477 485 515 540 601 504 428 340 344 351 242 599 359 22 1839 312 108 47 1835 152 279 864 552 507 615 534 528 468 493 521 475 468 492 470 472 503 486 498 486 533 479 483 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.00 0.03 -0.02 0.01 0.03 0.03 -0.02 -0.01 0.03 -0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 -0.03 -0.02 0.00 -0.01 -0.01 -0.02 0.03 -0.03 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.01 0.01 -0.01 -0.01 0.02 -0.03 -0.02 -0.03 -0.00 -0.02 -0.02 -0.00 -0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.01 -0.01 -0.01 0.01 -0.01 -0.03 0.05 -0.00 -0.01 -0.02 0.04 0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 234

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 121

CWM

PFM

     

HCWM