Detailed information of deep learning profile BP001384.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZBED1 in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZBED1
Model ID: BP001384.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: BED zinc finger factors
JASPAR ID: MA0749.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: O96006  
Source: ENCSR286PCG
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.02 0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.02 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 123 139 115 119 126 122 118 119 119 97 138 150 137 113 103 68 87 139 128 146 106 21 8 117 28 24 524 5 401 135 104 116 150 146 129 120 144 111 115 127 121 127 139 122 125 115 120 118 129 115 ]
C [ 176 122 163 140 139 156 185 165 150 161 159 123 153 172 143 159 197 166 198 89 66 22 477 34 340 8 3 228 59 88 139 129 177 163 163 163 152 152 181 156 165 139 138 160 161 130 170 159 159 147 ]
G [ 142 133 154 169 169 157 145 125 145 186 132 143 163 134 170 213 138 116 139 84 320 42 4 390 22 502 11 5 19 189 175 199 125 139 156 132 138 134 139 147 138 158 161 161 150 178 149 147 145 162 ]
T [ 106 153 115 119 113 112 99 138 133 103 118 131 94 128 131 107 125 126 82 228 55 462 58 6 157 13 9 309 68 135 129 103 95 99 99 132 113 150 112 117 123 123 109 104 111 124 108 123 114 123 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.01 0.00 -0.01 -0.00 0.03 -0.01 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.01 -0.01 0.02 -0.01 0.02 -0.02 -0.01 0.01 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.01 0.02 -0.02 0.03 -0.01 -0.02 -0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 -0.01 0.02 0.00 -0.01 0.00 -0.01 -0.01 0.02 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_0

Num. of seqlets: 1779

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 807

CWM

PFM

     

HCWM