Detailed information of deep learning profile BP001382.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZSCAN22 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZSCAN22
Model ID: BP001382.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0668.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P10073  
Source: ENCSR050KWL
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.02 0.02 -0.00 0.03 0.03 -0.00 0.05 0.04 -0.00 -0.00 0.05 -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.05 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.04 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 607 561 554 555 715 634 636 575 574 547 538 536 833 493 536 371 237 176 192 172 99 435 36 65 1120 112 5 1591 78 2125 119 474 649 643 431 702 860 503 453 444 457 877 528 674 575 501 457 564 664 777 ]
C [ 942 982 1178 1152 957 945 876 1066 1219 1203 1287 1398 926 1027 963 807 2279 2357 214 2722 2309 415 2895 2789 1438 107 2878 105 107 159 2400 1128 1054 521 1139 685 793 900 857 1399 1383 951 876 916 1234 1245 1278 1337 1154 906 ]
G [ 921 781 682 746 842 953 989 862 752 822 754 534 775 1021 675 1567 196 209 599 62 117 926 21 42 308 52 10 386 2818 451 129 126 948 1296 1198 999 799 1092 589 663 605 658 1080 968 665 739 697 650 695 855 ]
T [ 613 759 669 630 569 551 582 580 538 511 504 615 549 542 909 338 371 341 2078 127 558 1307 131 187 217 2812 190 1001 80 348 435 1355 432 623 315 697 631 588 1184 577 638 597 599 525 609 598 651 532 570 545 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.01 -0.02 -0.01 0.00 -0.03 0.00 -0.02 -0.02 0.02 0.00 -0.04 0.01 0.00 0.03 -0.01 0.00 0.01 -0.01 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.03 0.02 -0.01 0.04 0.03 -0.01 0.05 0.04 0.00 -0.02 0.06 -0.02 -0.02 -0.02 0.03 0.00 0.00 0.00 0.01 ]
G [ 0.00 0.01 0.01 0.02 -0.01 0.00 0.02 -0.02 -0.00 0.03 -0.03 -0.01 0.02 -0.01 -0.04 0.02 0.05 0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.02 0.00 ]
T [ -0.00 0.00 0.00 -0.01 -0.01 -0.00 0.02 -0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.02 0.04 0.02 0.01 -0.02 0.01 0.01 0.02 -0.01 0.00 -0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 263

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 142

CWM

PFM

     

HCWM