Detailed information of deep learning profile BP001382.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZSCAN22 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZSCAN22
Model ID: BP001382.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0668.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: P10073  
Source: ENCSR050KWL
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ -0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.04 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.01 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.05 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 0.05 -0.00 -0.00 0.04 0.05 -0.00 0.03 0.03 -0.00 0.02 0.02 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 545 570 532 651 598 609 525 599 597 638 577 1184 588 631 697 315 623 432 1355 435 348 80 1001 190 2812 217 187 131 1307 558 127 2078 341 371 338 909 542 549 615 504 511 538 580 582 551 569 630 669 759 613 ]
C [ 855 695 650 697 739 665 968 1080 658 605 663 589 1092 799 999 1198 1296 948 126 129 451 2818 386 10 52 308 42 21 926 117 62 599 209 196 1567 675 1021 775 534 754 822 752 862 989 953 842 746 682 781 921 ]
G [ 906 1154 1337 1278 1245 1234 916 876 951 1383 1399 857 900 793 685 1139 521 1054 1128 2400 159 107 105 2878 107 1438 2789 2895 415 2309 2722 214 2357 2279 807 963 1027 926 1398 1287 1203 1219 1066 876 945 957 1152 1178 982 942 ]
T [ 777 664 564 457 501 575 674 528 877 457 444 453 503 860 702 431 643 649 474 119 2125 78 1591 5 112 1120 65 36 435 99 172 192 176 237 371 536 493 833 536 538 547 574 575 636 634 715 555 554 561 607 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.01 0.00 -0.01 0.02 0.01 0.01 -0.02 0.01 0.02 0.04 -0.02 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.01 0.02 -0.00 -0.01 -0.01 0.00 0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.02 0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.05 0.02 -0.04 -0.01 0.02 -0.01 -0.03 0.03 -0.00 -0.02 0.02 0.00 -0.01 0.02 0.01 0.01 0.00 ]
G [ 0.01 0.00 0.00 0.00 0.03 -0.02 -0.02 -0.02 0.06 -0.02 0.00 0.04 0.05 -0.01 0.03 0.04 -0.01 0.02 0.03 -0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.01 0.01 0.00 -0.01 0.03 0.00 0.01 -0.04 0.00 0.02 -0.02 -0.02 0.00 -0.03 0.00 -0.01 -0.02 -0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_2

Num. of seqlets: 263

CWM

PFM

     

HCWM

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_4

Num. of seqlets: 142

CWM

PFM

     

HCWM