Detailed information of deep learning profile BP001376.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF214 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF214
Model ID: BP001376.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1975.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9UL59  
Source: ENCSR993DED
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 0.01 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 ]
G [ 0.01 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.04 0.00 0.07 0.03 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.04 0.00 0.02 0.04 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.04 0.03 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 194 184 234 210 237 207 187 209 189 222 198 197 181 245 192 331 46 20 57 106 18 163 521 3 26 340 66 162 26 18 147 507 26 164 431 296 107 277 142 187 172 192 178 249 221 214 209 170 179 191 ]
C [ 122 154 106 132 109 122 120 144 139 163 144 83 67 168 264 185 47 32 153 19 33 15 8 12 128 194 371 259 31 164 87 58 28 61 62 110 147 108 142 86 120 169 170 115 127 134 120 158 125 159 ]
G [ 161 137 131 137 141 130 157 148 97 130 132 201 322 131 52 115 29 12 196 50 19 489 108 639 463 72 22 125 23 9 416 39 43 318 80 87 119 131 106 164 194 110 156 123 117 139 145 100 167 129 ]
T [ 195 197 201 193 185 213 208 171 247 157 198 191 102 128 164 41 550 608 266 497 602 5 35 18 55 66 213 126 592 481 22 68 575 129 99 179 299 156 282 235 186 201 168 185 207 185 198 244 201 193 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.01 0.00 0.00 0.01 0.02 -0.01 -0.01 -0.00 0.01 -0.03 0.02 0.03 -0.02 -0.02 0.02 -0.00 0.00 -0.02 -0.02 0.02 0.04 -0.01 0.00 0.03 0.01 -0.01 ]
C [ 0.01 -0.00 0.02 0.02 0.01 -0.01 0.01 0.02 -0.02 0.02 -0.02 -0.00 0.02 0.03 0.03 0.05 0.03 0.00 0.05 0.01 0.00 0.01 0.00 -0.00 0.01 0.01 ]
G [ 0.01 0.02 0.01 -0.00 0.01 -0.00 -0.01 0.02 -0.00 -0.01 0.06 0.02 0.07 0.05 0.01 -0.00 0.04 -0.00 -0.04 0.04 -0.01 -0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.02 0.04 0.04 0.00 0.03 0.04 -0.02 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 0.01 -0.01 0.05 0.04 -0.03 -0.00 0.04 0.00 -0.01 0.01 0.02 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 329

CWM

PFM

     

HCWM