Detailed information of deep learning profile BP001376.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF214 in HEK293 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF214
Model ID: BP001376.1
Cell line/tissue: HEK293
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: MA1975.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9UL59  
Source: ENCSR993DED
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.03 0.04 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.04 0.02 0.00 0.04 0.03 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.07 0.00 0.04 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.01 ]
G [ 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 0.01 0.02 0.01 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.02 -0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.03 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 193 201 244 198 185 207 185 168 201 186 235 282 156 299 179 99 129 575 68 22 481 592 126 213 66 55 18 35 5 602 497 266 608 550 41 164 128 102 191 198 157 247 171 208 213 185 193 201 197 195 ]
C [ 129 167 100 145 139 117 123 156 110 194 164 106 131 119 87 80 318 43 39 416 9 23 125 22 72 463 639 108 489 19 50 196 12 29 115 52 131 322 201 132 130 97 148 157 130 141 137 131 137 161 ]
G [ 159 125 158 120 134 127 115 170 169 120 86 142 108 147 110 62 61 28 58 87 164 31 259 371 194 128 12 8 15 33 19 153 32 47 185 264 168 67 83 144 163 139 144 120 122 109 132 106 154 122 ]
T [ 191 179 170 209 214 221 249 178 192 172 187 142 277 107 296 431 164 26 507 147 18 26 162 66 340 26 3 521 163 18 106 57 20 46 331 192 245 181 197 198 222 189 209 187 207 237 210 234 184 194 ]

Hypothetical CWM

   
A [ 0.02 0.01 -0.01 0.00 0.04 -0.00 -0.03 0.04 0.05 -0.01 0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.02 0.04 0.03 0.00 0.04 0.04 -0.02 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.00 0.00 0.03 -0.00 -0.01 0.04 -0.04 -0.00 0.04 -0.00 0.01 0.05 0.07 0.02 0.06 -0.01 -0.00 0.02 -0.01 -0.00 0.01 -0.00 0.01 0.02 0.01 ]
G [ 0.01 0.01 -0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 0.05 0.00 0.03 0.05 0.03 0.03 0.02 -0.00 -0.02 0.02 -0.02 0.02 0.01 -0.01 0.01 0.02 0.02 -0.00 0.01 ]
T [ -0.01 0.01 0.03 0.00 -0.01 0.04 0.02 -0.02 -0.02 0.00 -0.00 0.02 -0.02 -0.02 0.03 0.02 -0.03 0.01 -0.00 -0.01 -0.01 0.02 0.01 0.00 0.00 0.01 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

 

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 329

CWM

PFM

     

HCWM