Detailed information of deep learning profile BP001371.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF296 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF296
Model ID: BP001371.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: UN0175.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q8WUU4  
Source: ENCSR862LJQ
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 509 503 491 475 487 507 493 493 475 449 490 452 512 442 466 440 484 466 420 464 581 768 460 555 19 152 981 11 1985 176 300 337 298 472 303 585 406 511 495 518 476 452 487 486 489 481 476 507 494 513 ]
C [ 844 809 805 824 822 770 796 786 835 811 833 886 823 873 846 691 733 835 935 899 910 681 1069 116 20 42 1036 2580 122 745 815 273 913 1100 1359 801 939 778 754 874 769 775 882 865 881 856 859 821 820 811 ]
G [ 815 818 834 872 846 849 856 828 832 887 799 819 794 825 735 1004 979 878 842 936 706 792 970 138 2562 2288 91 17 101 1288 408 1681 980 620 636 643 844 828 965 787 852 927 773 807 803 804 769 822 882 831 ]
T [ 449 486 487 446 462 491 472 510 475 470 495 460 488 477 570 482 421 438 420 318 420 376 118 1808 16 135 509 9 409 408 1094 326 426 425 319 588 428 500 403 438 520 463 475 459 444 476 513 467 421 462 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 294