Detailed information of deep learning profile BP001371.1

This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF296 in HepG2 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF296
Model ID: BP001371.1
Cell line/tissue: HepG2
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: Factors with multiple dispersed zinc fingers
JASPAR ID: UN0175.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q8WUU4  
Source: ENCSR862LJQ
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
G [ 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 ]

Frequency matrix

A [ 462 421 467 513 476 444 459 475 463 520 438 403 500 428 588 319 425 426 326 1094 408 409 9 509 135 16 1808 118 376 420 318 420 438 421 482 570 477 488 460 495 470 475 510 472 491 462 446 487 486 449 ]
C [ 831 882 822 769 804 803 807 773 927 852 787 965 828 844 643 636 620 980 1681 408 1288 101 17 91 2288 2562 138 970 792 706 936 842 878 979 1004 735 825 794 819 799 887 832 828 856 849 846 872 834 818 815 ]
G [ 811 820 821 859 856 881 865 882 775 769 874 754 778 939 801 1359 1100 913 273 815 745 122 2580 1036 42 20 116 1069 681 910 899 935 835 733 691 846 873 823 886 833 811 835 786 796 770 822 824 805 809 844 ]
T [ 513 494 507 476 481 489 486 487 452 476 518 495 511 406 585 303 472 298 337 300 176 1985 11 981 152 19 555 460 768 581 464 420 466 484 440 466 442 512 452 490 449 475 493 493 507 487 475 491 503 509 ]

Hypothetical CWM

A [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
G [ -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]

Other motifs identified by TF-MoDISco

Motif name: counts.pos_patterns.pattern_1

Num. of seqlets: 294