Detailed information of deep learning profile BP001370.1

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This page shows detailed deep learning-derived predictions and motifs for ZNF436 in K562 using a single trained BPNet model.

Model details

Name: ZNF436
Model ID: BP001370.1
Cell line/tissue: K562
Class: C2H2 zinc finger factors
Family: More than 3 adjacent zinc fingers
JASPAR ID: UN0324.2
Taxon: Vertebrates
Species: Homo sapiens
Data Type: ChIP-seq
Uniprot ID: Q9C0F3  
Source: ENCSR335SUD
Model: BPNet
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Contribution weight matrix (CWM)

 
A [ 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 -0.00 -0.00 0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
C [ 0.01 0.01 0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.06 -0.00 -0.00 0.05 0.02 0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.00 -0.00 0.01 ]
G [ -0.00 -0.00 -0.00 0.02 0.03 -0.00 0.01 0.04 0.01 0.00 0.00 0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.03 0.03 -0.00 0.02 0.04 -0.00 0.02 0.03 -0.00 0.01 0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 0.00 -0.00 0.00 0.03 0.02 -0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 -0.00 0.00 0.00 ]

Frequency matrix

       
A [ 279 236 258 264 203 230 289 172 279 588 532 105 54 493 305 107 44 856 493 34 176 11 30 13 4 82 52 76 51 988 117 10 948 166 26 168 199 372 78 455 122 140 161 271 460 241 167 229 263 396 ]
C [ 203 242 314 253 190 147 103 115 290 143 81 131 851 387 143 41 14 99 33 11 87 1081 47 66 1067 891 167 13 22 34 13 2 60 17 15 266 46 80 655 227 283 292 185 167 209 228 403 222 175 160 ]
G [ 420 455 331 296 507 565 543 682 294 285 411 221 86 71 490 904 1027 100 541 1023 804 0 36 151 5 27 40 972 1003 44 952 1061 24 908 1037 102 830 521 141 235 184 204 297 505 273 467 268 272 509 373 ]
T [ 194 163 193 283 196 154 161 127 233 80 72 639 105 145 158 44 11 41 29 28 29 4 983 866 20 96 837 35 20 30 14 23 64 5 18 560 21 123 222 179 507 460 453 153 154 160 258 373 149 167 ]

Hypothetical CWM

   
A [ -0.00 0.00 0.02 0.01 0.01 0.00 0.01 0.00 -0.00 -0.01 0.02 0.01 -0.01 0.01 0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.00 -0.01 -0.01 -0.00 0.03 0.00 -0.01 0.02 0.00 -0.02 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.00 0.00 ]
C [ -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.02 0.02 0.01 -0.01 -0.03 0.01 -0.00 -0.03 -0.01 0.06 -0.01 -0.02 0.05 0.03 0.01 -0.02 -0.02 -0.00 -0.02 -0.05 0.00 -0.01 -0.02 0.02 0.00 -0.00 0.01 -0.00 -0.00 -0.00 -0.00 ]
G [ 0.00 -0.01 -0.01 -0.01 -0.01 -0.02 -0.02 -0.00 0.02 0.03 -0.02 0.02 0.04 0.01 -0.04 0.00 0.01 -0.04 -0.01 -0.00 0.03 0.03 -0.02 0.02 0.04 -0.02 0.02 0.03 -0.03 0.01 0.00 -0.01 -0.00 0.00 -0.00 -0.00 ]
T [ -0.00 0.01 -0.00 -0.00 0.02 0.00 -0.00 -0.00 -0.01 0.00 -0.01 -0.02 -0.00 -0.00 -0.02 0.03 0.03 -0.00 -0.01 0.01 -0.00 -0.01 0.00 -0.00 0.01 0.00 -0.02 0.01 0.01 -0.01 0.00 0.01 -0.00 0.01 0.00 0.00 ]